常规PCR、实时定量PCR检测传染性皮下及造血器官坏死病毒的效果分析

被引:5
作者
周优 [1 ]
岳志芹 [2 ]
梁成珠 [2 ]
徐彪 [2 ]
朱来华 [2 ]
高宏伟 [2 ]
孙敏 [2 ]
刘荭 [3 ]
汪东风 [1 ]
机构
[1] 中国海洋大学
[2] 山东出入境检验检疫局
[3] 深圳出入境检验检疫局
关键词
凡纳滨对虾; 传染性皮下及造血器官坏死病毒(IHHNV); 实时定量PCR; 常规PCR; 测序;
D O I
暂无
中图分类号
S945.4 [各种虾的病虫害及其防治];
学科分类号
摘要
对虾传染性皮下及造血器官坏死病毒(IHHNV)可感染世界各地养殖对虾,给对虾养殖业造成严重经济损失。本实验首次采用实时定量PCR法对广西地区的84份凡纳滨对虾样品进行检测,同时以常规PCR检测作对照。实时定量PCR检测阳性率为79·8%,常规PCR检测阳性率为40·5%,表明广西地区养殖的凡纳滨对虾IHHNV的感染率较高。将二者检测均呈阳性的30份样品扩增产物进行序列分析测序,测序结果通过DNA STAR软件包进行分析,并通过NCBI Blast与GenBank中的序列进行比对。结果证明,测定的是IHHNV序列。30份样品的IHHNV序列很保守,可以分为4种类型,仅有两个碱基的位置发生变异。实时定量PCR检测IHHNV,快速、灵敏、准确,特异性好,可以作为检测对虾感染病毒的有效方法。
引用
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