斑茅两个看家基因片段的克隆及其在基因芯片中的应用

被引：14

作者：

张积森

李伟

阙友雄

阮妙鸿

张木清

陈如凯

机构：

[1] 福建农林大学农业部甘蔗生理生态与遗传改良重点实验室

来源：

热带亚热带植物学报 | 2007年 / 04期

基金：

高等学校博士学科点专项科研基金;

关键词：

斑茅; 看家基因; 基因芯片; PEG;

D O I：

暂无

中图分类号：

Q943.2 [植物基因工程]; S566.1 [甘蔗];

学科分类号：

071007 ; 090102 ; 0901 ;

摘要：

根据已发表的同源基因序列,利用RT-PCR技术分离了斑茅(Erianthus arundinaceus)的GAPDH和APRT两个看家基因片段,用它们作为cDNA芯片阳性参照,以未经聚乙二醇(PEG)胁迫处理的斑茅叶片为对照,和PEG胁迫的4组材料同cDNA芯片进行杂交分析。杂交结果显示,GAPDH杂交的Cy5与Cy3平均信噪比(Signal/Noise,S/N)分别为56.12和60.8,APRT杂交的Cy5与Cy3平均信噪比分别为51.06和47.25,信噪比均很高;同时两个看家基因的杂交都显示出极强的信号,其中GAPDH的杂交信号值大于10000,APRT也在8000以上,杂交结果可靠。分析了PEG胁迫4个时段BADH与两个看家基因的表达,BADH的表达有明显变化,而看家基因表达均较稳定。上述结果表明所克隆的两个看家基因在斑茅中表达量高,且PEG胁迫下表达较为稳定,是基因芯片理想的阳性参照。

引用

页码：277 / 283

页数：7

共 6 条

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