油菜EST-SSR标记的建立

被引：30

作者：

李小白

张明龙

崔海瑞

机构：

[1] 浙江大学原子核农业科学研究所

来源：

分子细胞生物学报 | 2007年 / 02期

关键词：

油菜; EST; SSR信息; 标记建立;

D O I：

暂无

中图分类号：

S565.4 [油菜籽（芸薹）];

学科分类号：

0901 ;

摘要：

在油菜17987条非冗余EST中,共发掘出了2083个EST-SSR,分布于2443条EST中,发生频率是13.58%,平均分布距离为4.34kb。在油菜EST-SSR中,二、三核苷酸重复是主要的重复类型,二者出现的频率相近,占总SSR的89.05%。AG/CT和AAG/CTT是二、三核苷酸中的优势重复类型,分别占二、三核苷酸重复类型的84.31%和37.71%。进一步设计了23对SSR引物,通过梯度PCR试验确定了各引物的适宜退火温度,并利用非变性聚丙烯酰胺凝胶银染对这些引物在10个油菜品种中的扩增情况和多态性进行了检测。有21对引物显示扩增,引物可用率为91.30%;有12对引物显现出多态性,占可扩增引物的57.14%。本研究结果证明根据油菜EST建立SSR标记是有效、可行的。

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页码：137 / 144

页数：8

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