基于DGGE分析的大鼠粪便及肠道细菌DNA提取方法研究

被引:23
作者
郑刚 [1 ]
陈己任 [2 ]
胡博文 [2 ]
陈彦斌 [2 ]
赵国华 [1 ,3 ]
机构
[1] 西南大学食品科学学院
[2] 湖南农业大学园艺园林学院
[3] 重庆市农产品加工技术重点实验室
关键词
DNA提取; 大鼠; 粪便; 肠道菌群; DGGE电泳;
D O I
暂无
中图分类号
Q93 [微生物学];
学科分类号
071005 [微生物学];
摘要
为获得高质量肠道细菌总DNA用于研究膳食纤维对大鼠肠道菌群的影响,本实验以SD大鼠为实验动物,灌胃番茄皮膳食纤维,收集大鼠粪便及盲肠,-70℃冰箱保存。分别采用Tiangen细菌基因组试剂盒法、蛋白酶K-十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法和溶菌酶法提取粪便和肠道中的细菌总DNA,通过琼脂糖凝胶电泳、细菌通用引物PCR扩增和变性梯度凝胶电泳(DGGE)对提取效果进行观察比较,发现将溶菌酶法进行改进后,可以获得满意效果。改进后的溶菌酶法与另外两种方法比较,具有成本低、时间短、DNA得率高和多样性好等特点;该方法获得的DNA样品适合于用DGGE技术分析大鼠粪便及肠道菌群。
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