一种基于PCR分析多样性的小鼠肠道微生物宏基因组提取方法附视频

被引:19
作者
吴海 [1 ]
周赛男 [2 ,1 ]
郭纯 [2 ,1 ]
谭周进 [2 ,1 ]
蔡光先 [2 ,1 ]
曾奥 [1 ]
张华玲 [1 ]
机构
[1] 湖南中医药大学
[2] 湖南省中药粉体与创新药物省部共建国家重点实验室培育基地
关键词
小鼠肠道菌群; 宏基因组DNA; PCR; 扩增核糖体限制性酶切片段分析;
D O I
10.13381/j.cnki.cjm.2012.07.003
中图分类号
Q78 [基因工程(遗传工程)];
学科分类号
071007 ; 0836 ; 090102 ;
摘要
目的建立一种基于PCR分析分子多样性的小鼠肠道菌群宏基因组提取方法。方法比较、综合国内外小鼠肠道菌群宏基因组的提取方法后建立一种新方法,小鼠肠道内容物经丙酮洗涤,差速离心,溶菌酶、SDS裂解,CTAB处理,酚/氯仿抽提后可得到高质量的DNA,通过紫外分光光度计、琼脂糖凝胶电泳、细菌通用引物PCR和扩增核糖体限制性酶切片段分析(ARDRA)等检测该方法的实用性。结果该方法获得的小鼠肠道菌群宏基因组DNA大小在23 kb左右,A260/A280在1.8~2.0,经细菌通用引物PCR后能得到适用于ARDRA的目的产物。结论该方法经济适用性较强,具备一定的应用价值。
引用
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