长梗木霉纤维素酶基因的克隆及序列分析

被引:10
作者
石贤爱 [1 ,2 ]
刘月 [1 ]
陈飞 [1 ]
杨锦 [1 ]
机构
[1] 福州大学生物科学与工程学院
[2] 福建省医疗器械和医药技术重点实验室
关键词
长梗木霉; ITS序列; 纤维素酶基因; 同源性;
D O I
10.13344/j.microbiol.china.2010.05.009
中图分类号
Q78 [基因工程(遗传工程)];
学科分类号
071007 ; 0836 ; 090102 ;
摘要
从富含纤维素环境筛选获得一株纤维素降解菌株FU05,通过形态学特征及ITS序列分析确定其为长梗木霉(Trichoderma longibrachiatum)。PCR扩增获得该菌株的bgl2、cbh2和eg1。序列分析表明,这3种纤维素酶基因与GenBank上其他木霉同种纤维素酶基因具有较高同源性:bgl2基因与里氏木霉bgl2基因(AB003110)同源性达91%;cbh2基因与康宁木霉cbh2基因(DQ504304)同源性达99%;eg1基因与长梗木霉eg1基因(X60652)同源性达95%。3种纤维素酶基因编码的相应氨基酸序列与其他木霉纤维素酶的氨基酸序列相似性也非常高。对上述纤维素酶基因编码的相应蛋白进行PROSITE motif search,对其N端糖基化位点、纤维素结合区、糖基水解酶家族特征结构区等进行了定位。
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