变性梯度凝胶电泳在环境微生物生态学中的应用

被引：10

作者：

单国彬 ^{[1
]}

金文标 ^{[2
]}

林佶侃 ^{[1
]}

邢新会 ^{[3
]}

机构：

[1] 东莞宝丽美化工有限公司

[2] 哈尔滨工业大学深圳研究生院城市与土木工程学院

[3] 清华大学化学工程系生物化工研究所

来源：

生态学杂志 | 2006年 / 10期

关键词：

PCR-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE); 废水生物处理; 微生物群落; 活性污泥; 生物膜; 硝化菌-反硝化菌; 硫酸还原菌;

D O I：

10.13292/j.1000-4890.2006.0239

中图分类号：

Q938-3 [];

学科分类号：

071005 ; 100705 ;

摘要：

PCR-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)具有可靠性强、重复性好、方便快捷等优点,已被广泛应用于环境生态学中微生物群落多样性、动态性分析和功能细菌的跟踪。本文综述了PCR-DGGE技术的基本原理,不同DNA提取方法的比较,不同PCR方式的比较及其在环境生态学中研究微生物群落多样性、环境中微生物群落变化的动态监测、硝化菌-反硝化菌和硫酸还原菌(SRB)的动态分析和监测等领域中的应用,并对该技术自身存在的局限性和应用前景进行了评价。

引用

页码：1257 / 1264

页数：8

共 65 条

[1]

Characterization of Microbial Communities Found in the Human Vagina by Analysis of Terminal Restriction Fragment Length Polymorphisms of 16S rRNA Genes. Marco J,Catherine C,Larry J, et al. Applied and Environmental Microbiology . 2005

[2] 垃圾填埋场细菌种群空间分布及组成多样性研究 [J].

陈红歌 ;

胡元森 ;

贾新成 ;

吴坤 .

环境科学学报, 2005, (06) :809-815

[3] PCR-DGGE法用于活性污泥系统中微生物群落结构变化的解析 [J].

刘新春 ;

吴成强 ;

张昱 ;

杨敏 ;

李红岩 .

生态学报, 2005, (04) :842-847

[4] 应用PCR-DGGE技术研究处理含氨废气的生物滤塔中微生物多样性 [J].

殷峻 ;

陈英旭 ;

刘和 ;

王远鹏 .

环境科学, 2004, (06) :11-15

[5]

Community analysis of ammonia oxidizer in the oxygen-limited nitritation stage of OLAND system by DGGE of PCR amplified 16S rDNA fragments and FISH[J]. ZHANG Dan 1,2,* , ZHANG De-min 3, LIU Yao-ping 2, CAO Wen-wei 1, CHEN Guan-xiong 2 (1. Department of Biology, Liaoning Normal University, Dalian 116021, China. ; 2. Institute of Applied Ecology, Chinese Academy of Sciences, Shenyang 110016, China; 3. Faculty of Life Science and Biotechnology, Ningbo University, Ningbo 315211, China). Journal of

[6] 重金属复合污染农田土壤DNA的快速提取及其PCR-DGGE分析 [J].

滕应 ;

骆永明 ;

赵祥伟 ;

李振高 ;

宋静 ;

吴龙华 .

土壤学报, 2004, (03) :343-347

[7]

Phylogenetic diversity of a SRB-rich marine biofilm[J] . T. Zhang,H. Fang. &nbspApplied Microbiology and Biotechnology . 2001 (3)

[8] Screening for genetic diversity of isolates of anaerobic Fe(II)-oxidizing bacteria using DGGE and whole-cell hybridization [J].

BuchholzCleven, BEE ;

Rattunde, B ;

Straub, KL .

SYSTEMATIC AND APPLIED MICROBIOLOGY, 1997, 20 (02) :301-309

[9] Evaluation of denaturing gradient gel electrophoresis in the detection of 16S rDNA sequence variation in rhizobia and methanotrophs [J].

Vallaeys, T ;

Topp, E ;

Muyzer, G ;

Macheret, V ;

Laguerre, G ;

Rigaud, A ;

Soulas, G .

FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY, 1997, 24 (03) :279-285

[10]

Influence of starvation on potential ammonia-oxidizing activity and amoA mRNA levels of Nitrosospira briensis. A Bollmann,I Schmidt,AM Saunders,MH Nicolaisen. Applied and Environmental Microbiology . 2005

← 1 2 3 4 5 6 7 →