若尔盖高原泥炭沼泽土嗜冷细菌系统发育分析

被引:6
作者
辜运富 [1 ]
郑有坤 [1 ]
Petri Penttinen [2 ]
王宪斌 [1 ]
张小平 [1 ]
机构
[1] 四川农业大学资源环境学院微生物系
[2] Department of Food and Environmental Sciences, University of Helsinki
关键词
泥炭沼泽土; 可培养嗜冷菌; 16S rRNA基因; 多样性; 若尔盖高原;
D O I
10.13248/j.cnki.wetlandsci.2014.05.014
中图分类号
Q93 [微生物学];
学科分类号
071005 ; 100705 ;
摘要
结合低温纯培养手段、核糖体DNA扩增片段限制性内切酶分析技术和克隆测序,研究了若尔盖高原泥炭沼泽土中可培养菌的多样性、系统发育和产低温酶特性。从3块采样地的土样中分离到47株表型各不相同的菌株。16S rRNA测序和系统发育分析结果表明,若尔盖高原泥炭沼泽土的可培养低温菌高度相似于分离自极地、高山冻土和冰川等低温环境的嗜冷菌。47株菌分属于4个不同的群,包括高GC含量群、低GC含量群、Beta和Gama变形菌纲等。革兰氏阳性菌以节杆菌属(Arthrobacter)为主,而革兰氏阴性菌以假单胞菌属(Pseudomonas)为主。其他的细菌分属于微小杆菌属(Exiguobacterium)、芽孢八叠球菌属(Sporosarcina)、贪噬菌属(Variovorax)、紫色杆菌属(Janthinobacterium)和寡养单胞菌属(Stenotrophomonas)等不同的类群。产低温酶分析结果表明,在分离到的47株菌中,大多数菌株都能分泌纤维素降解酶,50%以上的菌株具有蛋白酶活性,而以节杆菌的胞外酶产生能力最强。若尔盖高原泥炭沼泽土中存在丰富的低温菌类群,在酶学生物技术上具有潜在应用价值。
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