幽门螺杆菌硫氧还蛋白两种不同亚型基因序列的测定及分析

被引：7

作者：

石岩岩 ^{[1
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丁士刚 ^{[1
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鲁凤民 ^{[2
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张静 ^{[1
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陈香梅 ^{[2
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刘琳娜 ^{[1
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王晔 ^{[1
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机构：

[1] 北京大学第三医院消化科

[2] 北京大学医学部病原生物学系

来源：

中华医学杂志 | 2010年 / 40期

关键词：

螺杆菌,幽门; 硫氧还蛋白; 基因; 氨基酸类; 序列分析;

D O I：

暂无

中图分类号：

R686 [筋腱、韧带、滑囊疾病及损伤];

学科分类号：

100220 [骨科学];

摘要：

目的测定不同胃疾病分离的幽门螺杆菌(Hp)临床菌株中硫氧还蛋白(Trx)1、2基因序列,并确定其氨基酸序列,探讨其与相关疾病的关系。方法通过胃镜获取慢性胃炎、消化性溃疡、胃癌3种疾病共25例患者的胃黏膜组织,从中分离培养Hp菌株,提取基因组DNA。根据GenBank基因组中Hp基因序列设计Trx1、Trx2引物,应用聚合酶链反应(PCR)进行扩增,对扩增产物进行序列测定及生物信息学分析,并与国际标准菌株比对。结果应用PCR的方法成功扩增出Trx1全基因序列及Trx2基因前295核苷酸。应用BioEdit软件进行核苷酸和氨基酸同源性分析,不同疾病分离的Hp Trx1均含有321个核苷酸,总突变位点率13.4%(43/321);编码106个氨基酸,含有一个Cys-Gly-Pro-Cys氧化还原活性位点,25例不同胃疾病Hp TRX1的氨基酸同源性高达97.2%(103/106)。Trx2的前295个核苷酸,总突变位点率18.6%(55/295);编码的氨基酸无Cys-Gly-Pro-Cys,含有一个CXXC区域,氨基酸同源性为84.7%(83/98)。结论 Hp临床分离菌株的Trx两个亚型核苷酸序列均有不同程度的位点突变,但氨基酸的序列同源性较高,均为无效突变。不同疾病分离的Hp Trx1均含有一个Cys-Gly-Pro-Cys氧化还原活性位点,TRX2仅含有一个CXXC区域。研究结果为进一步探讨Hp Trx的生物学功能及其致病机制提供了可靠依据。

引用