禽流感病毒分型基因芯片的研制

被引:51
作者
韩雪清 [1 ]
林祥梅 [1 ]
侯义宏 [2 ]
吴绍强 [1 ]
刘建 [1 ]
梅琳 [1 ]
贾广乐 [1 ]
杨泽晓 [1 ]
机构
[1] 中国检验检疫科学研究院动植物检疫研究所
[2] 荆楚理工学院生物工程系
基金
国家科技攻关计划;
关键词
禽流感病毒; 分型; 基因芯片; 杂交; 检测;
D O I
暂无
中图分类号
S852.659.5 [];
学科分类号
摘要
【目的】禽流感病毒是一种全球重要的人和动物呼吸道病病原,快速确定其不同亚型对于全球流感监测具有重要的意义。本研究意在研制一种可同时鉴定禽流感病毒所有亚型的方法。【方法】根据GenBank上已发表的禽流感病毒不同亚型(16个HA亚型和9个NA亚型)的基因序列,设计合成了25对特异性引物和1对通用引物,然后以各亚型病毒的参考株RNA作为模板,建立扩增不同亚型的多重RT-PCR方法。参考各亚型病毒靶cDNAs区域的保守序列设计了52条亚型特异的探针,进而利用扩增的各亚型病毒的靶cDNAs对其特异性进行评价。在此基础上,将设计好的探针点制到处理好的玻片上,制备了禽流感病毒分型鉴定基因芯片,结合所建立的扩增不同亚型的多重RT-PCR方法,开发了禽流感病毒亚型鉴定基因芯片试剂。利用收集自49个地区的2653份标本对其特异性和敏感性进行了初步评价。【结果】用于评价的各亚型参考毒株均出现良好的特异性杂交信号,检测的敏感度可达2.47PFU/mL或2.5ng靶DNA片段,而且与禽类常见的IBV、NDV等6种病毒均无交叉反应。【结论】证明该病毒分型基因芯片具有良好的特异性、敏感性。
引用
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