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- [3] 医学分子病毒学.[M].金奇主编;.科学出版社.2001,
我国广东、福建地区2000～2001年手足口病肠道病毒71型分离株的种系进化分析
被引：108
作者：
林思恩
章青
谢华萍
谢健萍
何家鑫
董巧丽
方肇寅
机构：
[1] 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所腹泻室,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所腹泻室,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所腹泻室,广州儿童医院,福建省卫生防疫站,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所腹泻室,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所腹泻室北京,北京,北京,北京,北京
来源：
关键词：
手足口病;
肠道病毒属;
逆转录聚合酶链反应;
种系发生;
D O I：
暂无
中图分类号：
R373 [人体病毒学（致病病毒）];
学科分类号：
摘要：
目的 采用逆转录聚合酶链反应 (RT PCR)检测我国广东、福建地区 2 0 0 0～ 2 0 0 1年手足口病 (HFMD)散发病例中的肠道病毒 71型 (EV71) ,进而通过扩增VP1节段的核苷酸序列 ,进行毒株的种系进化分析。方法 以肠道病毒特异引物对EV 1、EV 2进行RT PCR ,经琼脂糖凝胶电泳鉴定为阳性的标本 ,进一步用EV71特异引物对 15 9S、16 2A进行RT PCR ,扩增的VP1节段经纯化后与测序载体pGEM T连接 ,转化大肠埃希菌DH5α ,筛选后测序。所得序列与我国深圳、上海、武汉地区的EV71流行株 ,中国台湾 1998年 4例HFMD暴发分离的EV71毒株 ,及来自美国、日本、匈牙利等国家地区的EV71毒株的核苷酸序列 ,用ClustalX 1 8和PHYLIP 3 5进行比对分析 ,构建种系进化树。结果 2 5份标本检测EV71的阳性率为 2 0 % ,所得序列经种系进化分析 ,与肠道病毒 71型的其他毒株同源 ,与深圳 1998年HFMD散发分离的EV71毒株同源性为 94 % ,与上海 2 0 0 0年HFMD暴发分离株同源性为94 %～ 96 % ,与武汉 1987年HFMD病例中分离的毒株同源性为 91% ,而与国外EV71毒株同源性仅为82 %～ 84 %。结论 EV71是我国南方地区HFMD的主要病原之一 ;我国大陆地区的EV71毒株在种系进化上有较高的同源性 ;与我国台湾地区大部分分离株亦有 90 %～ 91%的核苷酸
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