南方5省区柑橘黄龙病病原16S rDNA片段的克隆与序列分析

被引:16
作者
单振菊
冯震
周根
邓晓玲
机构
[1] 华南农业大学资源环境学院
基金
广东省科技计划; 广东省自然科学基金;
关键词
柑橘黄龙病; 16S rDNA; 基因克隆; 序列分析;
D O I
暂无
中图分类号
S436.66 [柑桔类病虫害];
学科分类号
摘要
采集了广东、广西、贵州、福建、云南5省区的8个柑橘黄龙病样品,利用黄龙病病原的特异引物对其16S rD-NA片段进行PCR扩增,将其扩增产物纯化、回收,并与pMD18-T Vector连接,转化大肠杆菌(Esherichia coli)DH5α,筛选含有黄龙病病原16S rDNA片段的阳性克隆,进行序列测定.利用生物信息学软件对所克隆的序列进行同源性分析和聚类分析.结果表明:来自我国南方5省区的柑橘黄龙病病原16S rDNA的序列与亚洲种(L22532)的同源性为96.9%98.6%,与非洲种(L22533)的同源性为94.5%97.1%,与美洲种(AY742824)的同源性为92.5%94.2%.表明我国南方5省区柑橘黄龙病均属于亚洲种,但在亚洲种内部不同地区的黄龙病病原也发生了微小的变异,其中福建厦门和云南个旧的2个菌株变异较大.
引用
收藏
页码:25 / 29
页数:5
相关论文
共 7 条
[1]   沙田柚黄龙病病原16S rDNA片段的克隆与序列分析 [J].
冯震 ;
单振菊 ;
周根 ;
邓晓玲 .
广西农业生物科学, 2006, (02) :107-110+124
[2]   一株野生细菌的16Sr DNA序列分析与系统发育树的构建 [J].
张会敏 ;
冯友军 .
生物信息学, 2005, (01) :1-4+18
[3]   柑桔黄龙病病原16SrDNA克隆、测序及实时荧光PCR检测方法的建立 [J].
廖晓兰 ;
朱水芳 ;
赵文军 ;
罗宽 ;
漆艳香 ;
陈红运 ;
何昆 ;
朱晓湘 .
农业生物技术学报, 2004, (01) :80-85
[4]   快速检测柑桔黄龙病病原的研究 [J].
邓晓玲 ;
梁志慧 ;
唐伟文 .
华南农业大学学报, 1999, (01) :4-7
[5]   柑桔黄梢(黄龙)病的进一步研究 [J].
林孔湘 .
植物保护学报, 1963, (03) :243-251
[6]  
柑桔黄梢(黄龙)病研究 Ⅰ.病情调查[J]. 林孔湘.植物病理学报. 1956(01)
[7]   PCR detection of the two 'Candidatus' liberobacter species associated with greening disease of citrus [J].
Jagoueix, S ;
Bove, JM ;
Garnier, M .
MOLECULAR AND CELLULAR PROBES, 1996, 10 (01) :43-50