猪繁殖与呼吸综合征病毒北京分离株的ORF7克隆与序列分析

被引:6
作者
高云
杨汉春
任慧英
机构
[1] 中国农业大学动物医学院!北京
基金
“九五”攻关项目;
关键词
猪繁殖与呼吸综合征病毒; BJ2; BJ4; ORF7; 序列分析;
D O I
10.16656/j.issn.1673-4696.1999.10.001
中图分类号
S852.65 [家畜病毒学];
学科分类号
摘要
将北京地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV) 分离株BJ 2 和BJ 4 的ORF 7 及部分3’端非编码区( UTR) 的RT PCR 扩增产物克隆连接于p GEM Teasy 质粒载体上,重组质粒经EcoR Ⅰ酶切鉴定后进行了双链测序。测定的基因序列与欧美标准毒株已知序列比较发现,BJ 2 和BJ 4 株与美洲VR 2332 株非常接近,在其长度为555 bp 的cDNA 序列中,仅与VR 2332 株分别相差1 和2 个核苷酸,其中ORF 7 的核苷酸序列与VR 2332 株同源性分别高达100 % 和99 .46 % ,其推导的氨基酸序列与VR 2332 株同源性分别为100 % 和99 .25 % ,3’UTR 则完全相同;而与欧洲LV 株则有明显差异,其核苷酸序列同源性仅为68 .00 % 和67 .00 % ,推测的氨基酸序列同源性仅有65 .00 % 和64 .00 % ,且BJ 2 和BJ 4 株与LV 株相比缺失了KKSTAPM 和ASQG 两段氨基酸序列,而3’UTR 则比LV 株多出38 nt 的一段特征性核苷酸序列。序列分析结果表明,BJ 2 和BJ 4 株属于同一基因型,且具有VR 2332 株的基因特点
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