汉坦病毒汉滩型特殊新亚型的发现

应用RT -PCR扩增了皖南山区分离株AH0 9的M和S片段全基因 ,克隆于T载体 ,纯化后测定序列。结果AH0 9株M片段的全基因序列共 36 2 5个核苷酸 ,编码 1135个氨基酸 ;S片段的全基因序列共 172 4个核苷酸 ,编码 430个氨基酸。M和S片段全基因核苷酸和氨基酸与汉坦病毒各型毒株的代表株和HTN型毒株的同源性比较表明 ,AH0 9株分枝与HTN型接近 ,与其它各型病毒则相距较远 ,故确定为HTN型毒株。但AH0 9株与HTN型毒株的M和S片段全基因序列有差异 ,其差异分别高达 2 3 6 %和 2 0 4%。经种系发生分析 ,AH0 9株是迄今为止所发现的HTN型病毒中差异最大的新基因亚型病毒株。AH0 9株病毒M片段的氨基酸与HTN型相差 13 5 %至14 8% ,而S片段仅相差 7%～ 8 1% ,说明AH0 9毒株的变异主要发生在M片段。而ORF和 3′端的NCR区核苷酸序列分析比较说明 ,病毒的变异更主要集中在该片段的 3′端的NCR区