基于基因表达谱的肿瘤特异基因表达模式研究

被引：5

作者：

阮晓钢

李颖新

李建更

龚道雄

王金莲

机构：

[1] 北京工业大学电子信息与控制工程学院

来源：

中国科学C辑:生命科学 | 2006年 / 01期

关键词：

肿瘤; 特征基因选取; 基因表达谱; 支持向量机;

D O I：

暂无

中图分类号：

R73-3 [肿瘤学实验研究];

学科分类号：

摘要：

基于肿瘤基因表达谱,利用生物信息学的方法,从肿瘤与正常组织的样本分类入手就肿瘤特异表达基因的发现及其表达模式问题进行了分析和研究,进而探讨了肿瘤在基因表达上的特点.首先,在分析肿瘤基因表达谱特点的基础上,提出了基于Relief算法的样本分类特征基因选取策略;然后,以支持向量机为分类工具进行样本类型的识别,以分类错误率为标准选取样本分类特征基因,并对其中反映肿瘤与正常样本组织构成特点的组织特异表达基因进行排除以突出肿瘤样本真实的类别特征;最后结合统计学方法,从信息学的角度论证了分类特征基因在肿瘤组织中特异表达的确实性和普遍性,并对这些基因在肿瘤组织中呈现出的特异的表达模式进行了分析.

引用

页码：86 / 96

页数：11

共 8 条

[1]

分子肿瘤学概论.[M].王瑞年主编;.上海科技教育出版社.2001,

[2] 一种肿瘤基因表达数据的知识提取方法 [J].