鹅细小病毒非结构蛋白和结构蛋白的二级结构及B细胞抗原表位预测

被引：11

作者：

于天飞

马波

邢明伟

靳淼

刘海暇

李俚

王君伟

机构：

[1] 东北农业大学动物医学院

来源：

中国家禽 | 2007年 / 07期

关键词：

鹅细小病毒; 非结构蛋白; 结构蛋白; 二级结构; 抗原表位;

D O I：

10.16372/j.issn.1004-6364.2007.07.003

中图分类号：

S852.65 [家畜病毒学];

学科分类号：

090601 ;

摘要：

利用DNAStar软件包中的Editseq将GPV H1株非结构蛋白和结构蛋白核苷酸序列翻译成氨基酸序列,然后利用Protean软件进行氨基酸序列分析,分别预测结构蛋白和非结构蛋白的二级结构及B细胞抗原表位。结果表明,GPVH1株非结构蛋白和结构蛋白具有丰富的二级结构和多处抗原指数较高的区段,其中非结构蛋白的NS2和结构蛋白的VP3含有较多的潜在的B细胞优势抗原表位。

引用

页码：7 / 10

页数：4

共 10 条

[1] 鹅细小病毒NS1基因的克隆及原核表达 [J].

王君伟 ;

李勐 ;

马波 ;

布日额 ;

刘宝全 ;

Ulrich Neumann .

中国兽医杂志, 2004, (01) :10-13

[2] 鹅细小病毒VP1基因的克隆及序列分析 [J].

马波 ;

王君伟 ;

李洪涛 ;

刘宝全 .

中国兽医科技, 2003, (12) :6-9

[3] 抗小鹅瘟病毒中和性单克隆抗体的研制及实验防治效果 [J].

李新华 .

中国畜禽传染病, 1998, (04) :56-58

[4]

GPV VP及NS基因克隆及其原核表达产物的研究和应用[D]. 布日额.东北农业大学 2005

[5]

动物病毒学[M]. 科学出版社 , 殷震,刘景华主编, 1997

[6] Expression of capsid proteins and non-structural proteins of waterfowl parvoviruses in Escherichia coli and their use in serological assays [J].

Wang, CY ;

Shieh, HK ;

Shien, JH ;

Ko, CY ;

Chang, PC .

AVIAN PATHOLOGY, 2005, 34 (05) :376-382

[7]

Analysis of the Complete Nucleotide Sequences of Goose and Muscovy Duck Pervoviruses Indicates Common Ancestral Origin with Adeno-Associated Virus 2[J] . Zoltán Zádori,Raymund Stefancsik,Tibor Rauch,János Kisary.Virology . 1995 (2)

[8] GOOSE PARVOVIRUS - AN AUTONOMOUS MEMBER OF THE DEPENDOVIRUS GENUS [J].

BROWN, KE ;

GREEN, SW ;

YOUNG, NS .

VIROLOGY, 1995, 210 (02) :283-291

[9] CHARACTERISTICS OF THE GENOME OF GOOSE PARVOVIRUS [J].

ZADORI, Z ;

ERDEI, J ;

NAGY, J ;

KISARY, J .

AVIAN PATHOLOGY, 1994, 23 (02) :359-364

[10]

Virus taxonomy. Fauquet C M,Mayo M A,Maniloff J, et al. VIIIth report of the ICTV . 2004

← 1 →