应用PCR-DGGE技术分析黄海冷水团海域的细菌群落组成

被引：22

作者：

刘敏 ^{[1
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朱开玲 ^{[1
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李洪波 ^{[1
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张涛 ^{[2
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肖天 ^{[1
]}

机构：

[1] 中国科学院海洋研究所海洋生态与环境科学重点实验室

[2] 国家海洋局第二海洋研究所卫星海洋环境动力学国家重点实验室

来源：

环境科学 | 2008年 / 04期

关键词：

细菌群落组成; 16SrDNA序列分析; PCR-DGGE; 黄海冷水团;

D O I：

10.13227/j.hjkx.2008.04.029

中图分类号：

X172 [环境微生物学];

学科分类号：

071012 ; 0713 ;

摘要：

利用PCR-DGGE技术对2个季节(2006-04和2006-10)的黄海冷水团海域的细菌群落组成和优势菌群进行了分析.通过软件Glyko Bandscan分析DGGE图谱,4月份所有站位的条带数相近(约17条),多样性丰富;10月份,在冷水团范围以内站位的条带约16条,其多样性也较丰富;而在冷水团范围以外站位的条带少(约12条),其多样性较低.细菌16S rDNA V3区特征片段经DGGE分离、条带切割,共得到24条条带,克隆、测序后,进行系统进化分析,结果显示这24条带分别归属于2个细菌类群:变形细菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroides).在24条序列中有16条分别与变形细菌亚群的γ-和δ-Proteobacteria相似,有5条与拟杆菌门相似.时空分析发现,4月份所有站位水体(海水温度为7～12℃)的细菌群落组成和10月份(冷水团存在期)冷水团内部水体(海水温度低于10℃)的细菌群落组成相同(都包括γ-Proteobacteria、δ-Proteobacteria和Bacteroides),与10月份冷水团外部水体(海水温度大于19℃)的(包括γ-Proteobacteria和Bacteroides)不同.优势菌群也存在同样的分布特点,4月份所有站位水体的优势菌群与10月份冷水团内部水体的优势菌群也相同(都是γ-Proteobacteria),而10月份冷水团外部水体不同的站位优势菌群不同.该海域细菌群落组成和优势菌群的分布特点,可能与冷水团的形成有一定的相关性.

引用

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页数：10

共 17 条

[1] 利用FISH和DGGE对产甲烷颗粒污泥中微生物种群的研究 [J].