SNP分型前的PAGE检测

被引：3

作者：

朱伟锋

蔡贵庆

黄艳梅

徐基清

区敬华

伍新尧

机构：

[1] 中山大学中山医学院法医物证教研室

来源：

生物技术 | 2006年 / 05期

基金：

广东省自然科学基金;

关键词：

聚丙烯酰胺凝胶电泳; 单核苷酸多态性; 变性高效液相色谱;

D O I：

10.16519/j.cnki.1004-311x.2006.05.008

中图分类号：

R346 [];

学科分类号：

摘要：

目的：探讨单核苷酸多态性(single nucleotide polymmphism,SNP)分型前聚丙烯酰胺凝胶电泳(polyaerylamide gel electro—phoresis,PAGE)的作用。方法：对3个DNA片段(DAOA基因的片段E1和E2、RGS4基因的片段S4)的PCR产物先用PAGE分析,然后用变性高效液相色谱(denaturing high performance liquid chromatography,DHPLC)分型,并比对结果。结果：PAGE能将片段E1、E2和S4中同一位点的SNP杂合子样本和纯合子样本区分开来,还能进一步将片段S4中SNP位点的2种不同纯合子样本区分开来。结论：PAGE能提高SNP的检测效率,而且具有成本低,操作简便的特点。

引用

页码：20 / 23

页数：4

共 20 条

[1] The use of single-nueleotide polymorphism maps in pharmacogenomics. McCarthy J J,,Hilfiker R. Nature Biotechnology . 2000
[2] 变性高效液相色谱法筛选鼻咽癌相关基因单核苷酸多态性
黄华
江培洲
沈新明
姚开泰
周宇凤
[J]. 第一军医大学学报, 2002, (07) : 602 - 604
[3] 变性高效液相色谱与直接测序法在单核苷酸多态性检测中的应用比较
施锦绣
杨爽
姜正文
江宏铨
陈天瑜
陈竺
黄薇
[J]. 中华医学遗传学杂志, 2001, (03) : 37 - 40
[4] SNP alleles in human disease and evolution
Shastry, BS
[J]. JOURNAL OF HUMAN GENETICS, 2002, 47 (11) : 561 - 566
[5] DHPLC-based germline mutation screening in the analysis of the VHL tumor suppressor gene: usefulness and limitations[J] . Bettina Klein,Gregor Weirich,Hiltrud Brauch. &nbspHuman Genetics . 2001 (5)
[6] A comparison of BRCA1 mutation analysis by direct sequencing, SSCP and DHPLC[J] . E. Gross,N. Arnold,J. Goette,U. Schwarz-Boeger,M. Kiechle. &nbspHuman Genetics . 1999 (1-2)
[7] Evaluation and application of denaturing HPLC for mutation detection in Marfan Syndrome:Identification of 20 novel mutations and two novel polymorphisms in the FBN1 gene. Mayas G,De Paepe A,Halliday D,et al. Human Mutation . 2002
[8] In-depth mutation and SNP discovery using DHPLC gene scanning. Lilleberg S L. Current Opinion in Drug Discovery and Development . 2003
[9] Association and linkage analyses of RGS4 polymorphisms in schizophrenia. Chowdari KV,Mimics K,Semwal P,et al. Hnm Mol Genet . 2002
[10] Blind analysis of denaturing high-performance liquid chromatography as a tool for mutation detection. O‘Donovan M C,Oefner P J,Roberts S C,et al. Genomics . 1998

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