采用变性梯度凝胶电泳研究羊肚菌土壤真菌群落结构

被引:12
作者
沈洪 [1 ,2 ]
汪虹 [1 ]
赵永昌 [3 ]
冯爱萍 [1 ]
陈明杰 [1 ]
潘迎捷 [4 ]
机构
[1] 农业部应用真菌资源与利用重点开放实验室,上海市食用菌工程技术研究中心,上海市农业遗传育种重点实验室,上海市农业科学院食用菌研究所
[2] 南京农业大学生命科学院微生物系
[3] 云南省农业科学院生物技术资源研究所
[4] 上海海洋大学
关键词
羊肚菌; 土壤真菌群落; PCR-DGGE;
D O I
10.16488/j.cnki.1005-9873.2009.02.004
中图分类号
S646 [菌类(食用菌)];
学科分类号
090202 ;
摘要
采用变性梯度凝胶电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis)技术以土壤微生物群体的基因组DNA为研究对象,通过比较羊肚菌(Morchella sp.)出菇土壤及对照土壤中各种真菌的28S rDNA基因信息来了解土壤微生物的多样性。结果发现,测得的12种真菌中,盘菌纲的有10种,异担子菌纲1种,还有1种未确定。所取2份土样中仅羊肚菌生长土壤中检测出有羊肚菌;2份样品在优势真菌种群上有一定的区别,盘菌纲真菌群落存在很大的差异,羊肚菌出菇土壤的真菌丰度低于对照,可能与土壤中羊肚菌优势种群对其它种群的抑制作用有关。
引用
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