利用EST-SSR分析江北茶区茶树资源的遗传多样性和遗传结构

被引：36

作者：

姚明哲 ^{[1
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刘振 ^{[2
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陈亮 ^{[2
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王新超 ^{[2
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马春雷 ^{[2
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梁月荣 ^{[1
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机构：

[1] 浙江大学农业与生物技术学院

[2] 中国农业科学院茶叶研究所/国家茶树改良中心

来源：

茶叶科学 | 2009年 / 29卷 / 03期

基金：

浙江省自然科学基金;

关键词：

茶树; EST-SSR; 遗传多样性; 遗传结构;

D O I：

10.13305/j.cnki.jts.2009.03.008

中图分类号：

S571.1 [茶];

学科分类号：

0902 ; 090203 ;

摘要：

利用25对EST-SSR引物对江北茶区的45份茶树初级核心种质的遗传多样性、遗传结构和亲缘关系进行了分析。25对引物共检测到83个等位位点,平均每对引物可检测到等位位点3.3个,可鉴定的基因型为6个。引物的PIC值平均为0.61,扩增位点的观测杂合度高于期望杂合度。45份供试种质中可观测的等位位点平均为4.2个,有效等位位点为2.8个。等位位点观测杂合度平均为0.73,基因多样性指数为0.61,Shannon信息指数为1.11。江北茶区主要省份间茶树种质的遗传分化程度较低(Gst=0.2),而基因流(Nm=3.9)较高。AMOVA分析显示,95.97%的变异发生于居群内。45份供试种质间的遗传相似系数在0.32～0.89之间,聚类分析表明供试资源在亲缘关系上未表现出明显的地区分化。湖北、安徽和陕西三个主要省份茶树种质间的遗传距离平均为0.048,其中陕西资源在亲缘关系上略远于湖北和安徽。

引用

页码：243 / 250

页数：8

共 10 条

[1] 基于EST-SSR的西南茶区茶树资源遗传多样性和亲缘关系分析
刘振
王新超
赵丽萍
姚明哲
王平盛
许玫
唐一春
陈亮
[J]. 分子植物育种, 2008, (01) : 100 - 110
[2] 茶树EST-SSR的信息分析与标记建立
金基强
崔海瑞
陈文岳
卢美贞
姚艳玲
忻雅
龚晓春
[J]. 茶叶科学, 2006, (01) : 17 - 23
[3] 茶树基因组DNA提纯与鉴定
陈亮
陈大明
高其康
杨亚军
虞富莲
[J]. 茶叶科学, 1997, (02) : 19 - 23
[4] 中国茶树品种志[M]. 上海科学技术出版社 , 《中国茶树品种志》编写委员会编著, 2001
[5] Genetic diversity among tea cultivars from China, Japan and Kenya revealed by ISSR markers and its implication for parental selection in tea breeding programmes[J] . M. Z.Yao,L.Chen,Y. R.Liang.Plant Breeding . 2008 (2)
[6] Generation and characterization of 24 novel EST derived microsatellites from tea plant (Camellia sinensis) and cross-species amplification in its closely related species and varieties
Zhao, Li-Ping
Liu, Zhen
Chen, Liang
Yao, Ming-Zhe
Wang, Xin-Chao
[J]. CONSERVATION GENETICS, 2008, 9 (05) : 1327 - 1331
[7] Isolation and characterization of 11 microsatellite loci from Camellia sinensis in Taiwan using PCR-based isolation of microsatellite arrays (PIMA)
Hung, Cheng-Yu
Wang, Kuo-Hsiung
Huang, Chi-Chun
Gong, Xun
Ge, Xue-Jun
Chiang, Tzen-Yuh
[J]. CONSERVATION GENETICS, 2008, 9 (03) : 779 - 781
[8] Differentiation of Japanese green tea cultivars as revealed by RFLP analysis of phenylalanine ammonia-lyase DNA[J] . S. Matsumoto,Y. Kiriiwa,Y. Takeda.Theoretical and Applied Genetics . 2002 (6-7)
[9] Evaluation of the genetic diversity among elite tea ( Camellia sinensis var. sinensis ) accessions using RAPD markers[J] . Shiv S. Kaundun,Alexander Zhyvoloup,Young-Goo Park.Euphytica . 2000 (1)
[10] Diversity and genetic differentiation among populations of Indian and Kenyan tea (Camellia sinensis (L.) O. Kuntze) revealed by AFLP markers[J] . S. Paul,F. N. Wachira,W. Powell,R. Waugh.TAG Theoretical and Applied Genetics . 1997 (2)

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