四川光壳钉螺微卫星遗传变异的小尺度空间自相关分析

被引：2

作者：

郭俊涛 ^{[1
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周艺彪 ^{[1
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张志杰 ^{[1
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刘刚明 ^{[2
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依火伍力 ^{[2
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王海银 ^{[1
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赵根明 ^{[1
]}

机构：

[1] 复旦大学公共卫生学院流行病学教研室公共卫生安全教育部重点实验室

[2] 四川省普格县疾病预防控制中心

来源：

中华流行病学杂志 | 2009年 / 05期

关键词：

湖北钉螺; 微卫星; 空间自相关; Moran's I;

D O I：

暂无

中图分类号：

R184 [防疫措施和管理];

学科分类号：

100401 ;

摘要：

目的采用小尺度空间自相关分析方法对四川省普格县的湖北钉螺自然居群微卫星(SSR)遗传变异的空间结构进行分析,探讨湖北钉螺自然居群遗传变异的空间分布特征。方法选用5对SSR引物对湖北钉螺基因组DNA进行扩增,选择频率在15%～85%的72个SSR等位基因,运用等样本对频率方法划分14个距离等级分别计算空间自相关系数Moran's I。结果5对SSR引物经PCR扩增共得到274个等位基因,SSR等位基因的平均多态信息量高达0.965,表现出很高的遗传多态性。钉螺种群中39个SSR等位基因的遗传变异存在一定程度的空间结构,表现为不同模式的正空间自相关。根据这39个等位基因在14个距离等级上的平均Moran's I值,可以发现随着距离增大正空间自相关性逐渐减小,但未发现表现为负空间自相关的距离等级和等位基因。结论普格县湖北钉螺种群中SSR遗传变异的空间分布,表现为随着距离增加而减少的正空间自相关性。

引用

共 11 条

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