河南和新疆地区HIV-1毒株gp120和gag基因的变异分析

被引：10

作者：

宋艳辉 ^{[1
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邢辉 ^{[2
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王哲 ^{[3
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张远志 ^{[4
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孙峰 ^{[4
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何翔 ^{[2
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陈建平 ^{[2
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邵一鸣 ^{[1
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机构：

[1] 中国科学院武汉病毒研究所

[2] 中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心传染性疾病预防与控制国家重点实验室

[3] 河南省疾病预防控制中心

[4] 新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心

来源：

中国艾滋病性病 | 2007年 / 05期

关键词：

艾滋病病毒Ⅰ型; 基因距离; 选择压力; 系统进化树;

D O I：

10.13419/j.cnki.aids.2007.05.046

中图分类号：

R373.9 [其他病毒];

学科分类号：

100103 ; 100705 ;

摘要：

目的分析中国河南和新疆地区艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)毒株gp120和gag基因全长序列的变异特征。方法PCR扩增河南和新疆HIV-1确认阳性样本前病毒DNA gp120和gag全长基因,测序得到40份gp120和41份gag基因序列,用GCG软件包等软件进行分析。结果河南省HIV-1毒株为B′亚型,新疆维吾尔自治区HIV-1毒株为CRF07 BC亚型。B′亚型毒株gp120基因中变异程度最大的区段是V5区段,最小的是C1区段;CRF07BC亚型毒株中变异最大的是V1区段,最小的是C4区段。两种亚型毒株gp120和gag基因的Ks/Ka值<1(P<0.05)。结论对于病毒基因全长序列的分析可以更多地反映病毒的特性。gp120基因各个区段在B′和CRF07BC亚型毒株中的变异程度不一致。B′和CRF07 BC亚型毒株的gp120基因和gag基因都受到正向选择压力的作用。

引用

页码：405 / 408

页数：4

共 4 条

[1] 河南省某市既往有偿献血人群HIV感染情况分析 [J].