再测序芯片在北京首例人禽流感病例病原学检测中的应用

被引:1
作者
曲梅
石伟先
吕燕宁
黄芳
王全意
杨鹏
机构
[1] 北京市疾病预防控制中心
关键词
再测序芯片; 禽流感; H5N1;
D O I
暂无
中图分类号
R450 [];
学科分类号
摘要
目的利用再测序芯片对北京市首例人禽流感病例进行病原筛查和验证。方法采集病例咽拭子和气管抽吸物标本,利用real-ti me RT-PCR进行禽流感病毒H5N1亚型核酸检测;应用病原体再测序芯片对其进行复核,并对其它呼吸道病原体和流感病毒其它亚型进行筛查。结果气管抽吸物标本经real-ti me RT-PCR检测为禽流感病毒H5N1核酸阳性;再测序芯片检测的结果是获得了H5N1的非结构蛋白基因(NS)特异序列,通过与GenBank进行序列比对,确定为禽流感病毒H5N1核酸,并排除了30种流感病毒亚型和其它33种呼吸道病原体的感染。结论病原体再测序芯片具有高灵敏性和特异性,在北京市首例人禽流感病例的病原学筛查和验证中发挥了重要作用。
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