蒺藜苜蓿EST-SSRs分布特征及标记的开发

被引：11

作者：

屠德鹏 ^{[1
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魏臻武 ^{[1
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武自念 ^{[1
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雷艳芳 ^{[3
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张栋 ^{[1
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邱伟伟 ^{[1
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机构：

[1] 扬州大学动物科学与技术学院

[2] 扬州大学草业科学研究所

[3] 上海鼎牛饲料有限公司

来源：

草业科学 | 2011年 / 05期

关键词：

蒺藜苜蓿; EST-SSRs; 引物设计; 标记开发;

D O I：

暂无

中图分类号：

S541.9 [];

学科分类号：

摘要：

利用蒺藜苜蓿(Medicagotruncatula)EST数据库开发新的EST-SSRs标记,分析EST-SSRs的分布特征。利用SSRIT软件对NCBI上公布的285 285条蒺藜苜蓿EST序列进行SSR序列的检测,共检测出6 688个SSR序列,分布于6 512个EST中,占整个EST数据库的2.28%。其中二核苷酸重复基元出现的频率最高,占总EST-SSRs的34.4%(2 301条),其次是三核苷酸重复基元,占29.6%(1 982条),4～6核苷酸重复基元所占比例均较小。利用Pri mer Premier 5.0随机设计100对EST-SSRs引物,PCR扩增结果表明,85对引物在蒺藜苜蓿RIL群体亲本A17和A20上有清晰的扩增条带,占合成引物总数的85%,在RIL-8群体中检测到29个EST-SSRs引物有多态性,占可扩增引物的34.1%。本研究开发了85个蒺藜苜蓿EST-SSRs新标记。

引用

页码：746 / 752

页数：7

共 23 条

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