砂梨EST-SSR引物开发及其应用

被引：16

作者：

崔海荣 ^{[1
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刘金义 ^{[1
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佟兆国 ^{[1
]}

王新卫 ^{[1
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章镇 ^{[1
,2
]}

乔玉山 ^{[1
,2
]}

机构：

[1] 南京农业大学园艺学院

[2] 教育部园艺作物种质创新与利用工程研究中心

来源：

西北植物学报 | 2010年 / 08期

关键词：

砂梨; EST-SSR; 分子标记;

D O I：

暂无

中图分类号：

Q943.2 [植物基因工程];

学科分类号：

071007 ; 090102 ;

摘要：

利用GenBank和GDR数据库中的995条梨EST序列开发砂梨SSR引物,并根据开发的EST-SSR引物对砂梨西子绿×喜水F1群体的遗传变异进行分析.结果发现:(1)60个SSR位点分布于54条EST序列中,占整个EST数据库的5.4%,其中二核苷酸重复基元出现频率最高,达51.7%,其次为三核苷酸重复基元占25%.23类重复基序中AT重复基序出现的频率最高,为32.3%.(2)利用开发的25对EST-SSR引物对西子绿×喜水F1群体的遗传变异分析结果表明,其中9对引物呈现多态性,多态性引物占设计引物的36%;多态性引物扩增产物在F1群体中的等位基因数(No)平均为2,有效等位基因数(Ne)平均为1.932 4,平均杂合度观测值(Ho)和期望杂合度(He)分别为1和0.480 9.

引用

页码：1551 / 1556

页数：6

共 22 条

[1] 花生栽培种EST-SSRs分布特征及应用研究 [J].

梁炫强 ;

洪彦彬 ;

陈小平 ;

刘海燕 ;

周桂元 ;

李少雄 ;

温世杰 .

作物学报, 2009, 35 (02) :246-254

[2] 橡胶树EST-SSRs发掘研究 [J].

华玉伟 ;

卢轶 ;

龙青姨 ;

曾霞 ;

胡彦师 ;

黄华孙 .

热带作物学报, 2008, 29 (05) :583-588

[3] EST分子标记开发研究进展 [J].

陈全求 ;

詹先进 ;

蓝家样 ;

黄云 .

中国农学通报, 2008, (09) :72-77

[4] 一种从果树成熟叶片提取DNA的方法 [J].

佟兆国 ;

王富荣 ;

章镇 ;

赵剑波 ;

张开春 ;

闫国华 ;

周宇 ;

姜立杰 .

果树学报, 2008, (01) :122-125

[5] 茶树EST资源中SSR的信息分析 [J].

金基强 ;

李素芳 ;

龚晓春 ;

卢美贞 ;

姚艳玲 ;

忻雅 ;

崔海瑞 .

科技通报, 2006, (04) :471-476

[6] 柑橘EST-SSR分子标记分析(英文) [J].

江东 ;

钟广炎 ;

洪棋斌 .

遗传学报, 2006, (04) :345-353

[7] 白菜EST-SSR标记的通用性 [J].

忻雅 ;

崔海瑞 ;

张明龙 ;

姚艳玲 ;

卢美贞 ;

金基强 ;

林容杓 ;

崔水莲 .

细胞生物学杂志, 2006, (02) :248-252

[8] 从棉花ESTs数据库中筛选微卫星标记的初步研究 [J].

李华盛 ;

范术丽 ;

沈法富 .

棉花学报, 2005, (04) :211-216

[9] Mining and characterizing microsatellites from citrus ESTs [J].

Chen, CX ;

Zhou, P ;

Choi, YA ;

Huang, S ;

Gmitter, FG .

THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 2006, 112 (07) :1248-1257

[10] Study of simple sequence repeat (SSR) markers from wheat expressed sequence tags (ESTs) [J].

Nicot, N ;

Chiquet, V ;

Gandon, B ;

Amilhat, L ;

Legeai, F ;

Leroy, P ;

Bernard, M ;

Sourdille, P .

THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 2004, 109 (04) :800-805

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