基于PCR-DGGE的重金属污染土壤微生物种群指纹分析

被引:12
作者
李晔 [1 ]
孙丽娜 [1 ]
杨继松 [1 ]
杨晓波 [2 ]
曲亚军 [2 ]
机构
[1] 沈阳大学区域污染环境生态修复重点实验室
[2] 辽宁省地质勘察局
关键词
细河; 变性梯度凝胶电泳; 微生物; 多样性;
D O I
10.16258/j.cnki.1674-5906.2010.09.021
中图分类号
X172 [环境微生物学];
学科分类号
071012 ; 0713 ;
摘要
采用变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析方法,研究沈阳市细河沿岸重金属污染土壤中微生物结构多样性、种群丰富度及种群结构的动态变化规律。结果表明:直接从土壤中抽提总DNA,对16SrRNAV3可变区序列进行扩增,DGGE指纹图谱分析,微生物种群结构和变化规律明显,同时也表现为重金属污染程度越重,多样性指数越低;其中细河底泥重金属含量严重超标,多样性指数最低。经方差分析,重金属污染情况与Shannon-wiener多样性指数呈负相关,其中重金属污染对微生物的均匀度指数影响最显著,并且锌污染对其影响最大为-0.985。表明PCR-DGGE技术可以用于污染环境下微生物多样性研究,也为污染环境下土壤微生物多样性研究提供了新的实验方法与依据。
引用
收藏
页码:2204 / 2208
页数:5
相关论文
共 10 条
[1]   黄瓜连作对土壤微生物区系影响Ⅱ——基于DGGE方法对微生物种群的变化分析 [J].
胡元森 ;
吴坤 ;
李翠香 ;
贾新成 .
中国农业科学, 2007, (10) :2267-2273
[2]   沈阳市细河沿岸农田土壤重金属污染评价 [J].
杨继松 ;
孙丽娜 ;
杨晓波 ;
马力 .
农业环境科学学报, 2007, (05) :1933-1936
[3]   不同施肥制度土壤微生物量碳氮变化及细菌群落16S rDNA V3片段PCR产物的DGGE分析 [J].
刘恩科 ;
赵秉强 ;
李秀英 ;
姜瑞波 ;
Hwat Bing So .
生态学报, 2007, (03) :1079-1085
[4]   污染土壤微生物群落结构多样性及功能多样性测定方法 [J].
陈承利 ;
廖敏 ;
曾路生 .
生态学报, 2006, (10) :3404-3412
[5]   基于16SrRNA/DNA分析的土壤微生物生态学效应 [J].
黄进勇 ;
周伟 .
中国农学通报, 2006, (04) :291-294
[6]   镉胁迫下稻田土壤微生物基因多样性的DGGE分子指纹分析 [J].
段学军 ;
闵航 .
环境科学, 2004, (05) :122-126
[7]   重金属复合污染农田土壤DNA的快速提取及其PCR-DGGE分析 [J].
滕应 ;
骆永明 ;
赵祥伟 ;
李振高 ;
宋静 ;
吴龙华 .
土壤学报, 2004, (03) :343-347
[8]   PCR-DGGE技术在农田土壤微生物多样性研究中的应用 [J].
罗海峰 ;
齐鸿雁 ;
薛凯 ;
张洪勋 .
生态学报, 2003, (08) :1570-1575
[9]   皇甫川流域不同草地类型土壤中微生物多样性的初步研究 [J].
韩芳 ;
邵玉琴 ;
赵吉 .
内蒙古大学学报(自然科学版), 2002, (05) :552-557
[10]   Extraction and purification of DNA in rhizosphere soil samples for PCR-DGGE analysis of bacterial consortia [J].
Niemi, RM ;
Heiskanen, I ;
Wallenius, K ;
Lindström, K .
JOURNAL OF MICROBIOLOGICAL METHODS, 2001, 45 (03) :155-165