基于线粒体DNA D-loop序列分析养殖刀鲚与湖鲚的遗传多样性

被引:15
作者
徐钢春 [1 ]
魏广莲 [2 ]
李建林 [1 ]
徐跑 [1 ]
张呈祥 [3 ]
顾若波 [1 ]
机构
[1] 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室
[2] 南京农业大学无锡渔业学院
[3] 江阴市水产指导站
关键词
养殖刀鲚; 湖鲚; D-loop序列; 遗传多样性;
D O I
10.16535/j.cnki.dlhyxb.2012.05.013
中图分类号
S917.4 [水产动物学];
学科分类号
0908 ;
摘要
以线粒体DNA D-loop全序列为分子标记,研究了灌江纳苗养殖刀鲚Coilia nasus子三代(F3)和湖鲚Coilia nasus taihuensis在淡水生活环境下两个群体的遗传多样性。结果显示:养殖刀鲚的D-loop序列长度为1 210~1 252 bp,湖鲚的序列长度为1 252~1 290 bp;在两个群体19个个体中,共检测到变异位点(S)35个,其中单一多态位点14个,简约信息位点21个;有12种不同的单倍型,单倍型多态性(H)为0.924;核苷酸多样性(π)为0.0099,平均核苷酸差异数(K)为4.154;养殖刀鲚群体内的各遗传多样性参数稍高于湖鲚,说明养殖刀鲚比湖鲚的遗传多样性要丰富,保持着较高的遗传多样性;养殖刀鲚与湖鲚的平均遗传距离(0.0148)要远小于它们与七丝鲚Coilia grayi的平均遗传距离(0.0528、0.0537),同时系统发育树也表明,养殖刀鲚和湖鲚共同构成1个单系群,为两种生态型种群,尚未达到种或亚种的分化。
引用
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页数:5
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