一种新的三维氨基酸描述子及其在肽类药物QSAR中的应用

被引：4

作者：

仝建波

张生万

机构：

[1] 山西大学化学化工学院

来源：

物理化学学报 | 2007年 / 01期

关键词：

氨基酸; 肽; VSGETAWAY描述子; 定量构效关系;

D O I：

暂无

中图分类号：

TQ460.1 [基础理论];

学科分类号：

1007 ;

摘要：

从20种天然氨基酸197个GETAWAY指数经主成分分析得出一种新3D氨基酸描述子——VSGETAWAY[vector of principal component scores for GETAWAY(geometry,topology and atom-weights assembly)].将其应用于48个苦味活性二肽、31个血管舒缓激肽促进剂和20个促凝血酶原激酶抑制剂结构表征并以偏最小二乘(PLS)对3个体系建立定量构效关系(QSAR)模型,得复相关系数(Rc2um)与交互检验复相关系数(Qc2um)分别为0.887和0.753;0.995和0.708;0.999和0.802.研究结果表明,VSGETAWAY描述子操作简便、结构表达能力强,有望成为多肽药物QSAR研究中一种有效的结构表征方法.

引用

页码：37 / 43

页数：7

共 5 条

[1] 一组新氨基酸描述子用于肽定量构效关系研究 [J].

梁桂兆 ;

周鹏 ;

周原 ;

张巧霞 ;

李志良 .

化学学报, 2006, (05) :393-396+360

[2] 氨基酸结构描述子矢量VHSE及其在肽QSAR中的应用 [J].

梅虎 ;

周原 ;

孙立力 ;

李志良 .

化学通报, 2005, (07) :534-540

[3] 一种新的氨基酸描述子及其在肽QSAR中的应用 [J].

梅虎 ;

周原 ;

孙立力 ;

李志良 .

物理化学学报, 2004, (08) :821-825

[4] STATISTICAL-ANALYSIS OF THE PHYSICAL-PROPERTIES OF THE 20 NATURALLY-OCCURRING AMINO-ACIDS [J].

KIDERA, A ;

KONISHI, Y ;

OKA, M ;

OOI, T ;

SCHERAGA, HA .

JOURNAL OF PROTEIN CHEMISTRY, 1985, 4 (01) :23-55

[5]

Consonni,V,Todeschini,R,Pavan,M. J.Chem.Inf.Comput.Sci . 2002

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