Genomic Insights into Zika Virus Emergence and Spread

被引:47
作者
Grubaugh, Nathan D. [1 ]
Faria, Nuno R. [2 ]
Andersen, Kristian G. [1 ]
Pybus, Oliver G. [2 ]
机构
[1] Scripps Res Inst, Dept Immunol & Microbiol, La Jolla, CA 92037 USA
[2] Univ Oxford, Dept Zool, Oxford OX1 3PS, England
基金
欧洲研究理事会; 英国惠康基金;
关键词
INFECTIVITY; BRAZIL;
D O I
10.1016/j.cell.2018.02.027
中图分类号
Q5 [生物化学]; Q7 [分子生物学];
学科分类号
071010 ; 081704 ;
摘要
The emergence and spread of Zika virus in the Americas continues to challenge our disease surveillance systems. Virus genome sequencing during the epidemic uncovered the timescale of Zika virus transmission and spread. Yet, we are only beginning to explore how genomics can enhance our responses to emerging viruses.
引用
收藏
页码:1160 / 1162
页数:3
相关论文
共 15 条
[1]  
de Oliveira WK, 2017, LANCET, V390, P861, DOI [10.1016/s0140-6736(17)31368-5, 10.1016/S0140-6736(17)31368-5]
[2]   Ebola Virus Glycoprotein with Increased Infectivity Dominated the 2013-2016 Epidemic [J].
Diehl, William E. ;
Lin, Aaron E. ;
Grubaugh, Nathan D. ;
Carvalho, Luiz Max ;
Kim, Kyusik ;
Kyawe, Pyae Phyo ;
McCauley, Sean M. ;
Donnard, Elisa ;
Kucukural, Alper ;
McDonel, Patrick ;
Schaffner, Stephen F. ;
Garber, Manuel ;
Rambaut, Andrew ;
Andersen, Kristian G. ;
Sabeti, Pardis C. ;
Luban, Jeremy .
CELL, 2016, 167 (04) :1088-+
[3]   Virus genomes reveal factors that spread and sustained the Ebola epidemic [J].
Dudas, Gytis ;
Carvalho, Luiz Max ;
Bedford, Trevor ;
Tatem, Andrew J. ;
Baele, Guy ;
Faria, Nuno R. ;
Park, Daniel J. ;
Ladner, Jason T. ;
Arias, Armando ;
Asogun, Danny ;
Bielejec, Filip ;
Caddy, Sarah L. ;
Cotten, Matthew ;
D'Ambrozio, Jonathan ;
Dellicour, Simon ;
Di Caro, Antonino ;
Diclaro, Joseph W. ;
Duraffour, Sophie ;
Elmore, Michael J. ;
Fakoli, Lawrence S. ;
Faye, Ousmane ;
Gilbert, Merle L. ;
Gevao, Sahr M. ;
Gire, Stephen ;
Gladden-Young, Adrianne ;
Gnirke, Andreas ;
Goba, Augustine ;
Grant, Donald S. ;
Haagmans, Bart L. ;
Hiscox, Julian A. ;
Jah, Umaru ;
Kugelman, Jeffrey R. ;
Liu, Di ;
Lu, Jia ;
Malboeuf, Christine M. ;
Mate, Suzanne ;
Matthews, David A. ;
Matranga, Christian B. ;
Meredith, Luke W. ;
Qu, James ;
Quick, Joshua ;
Pas, Suzan D. ;
Phan, My V. T. ;
Pollakis, Georgios ;
Reusken, Chantal B. ;
Sanchez-Lockhart, Mariano ;
Schaffner, Stephen F. ;
Schieffelin, John S. ;
Sealfon, Rachel S. ;
Simon-Loriere, Etienne .
NATURE, 2017, 544 (7650) :309-+
[4]   Establishment and cryptic transmission of Zika virus in Brazil and the Americas [J].
Faria, N. R. ;
Quick, J. ;
Claro, I. M. ;
Theze, J. ;
de Jesus, J. G. ;
Giovanetti, M. ;
Kraemer, M. U. G. ;
Hill, S. C. ;
Black, A. ;
da Costa, A. C. ;
Franco, L. C. ;
Silva, S. P. ;
Wu, C. -H. ;
Raghwani, J. ;
Cauchemez, S. ;
du Plessis, L. ;
Verotti, M. P. ;
de Oliveira, W. K. ;
Carmo, E. H. ;
Coelho, G. E. ;
Santelli, A. C. F. S. ;
Vinhal, L. C. ;
Henriques, C. M. ;
Simpson, J. T. ;
Loose, M. ;
Andersen, K. G. ;
Grubaugh, N. D. ;
Somasekar, S. ;
Chiu, C. Y. ;
Munoz-Medina, J. E. ;
Gonzalez-Bonilla, C. R. ;
Arias, C. F. ;
Lewis-Ximenez, L. L. ;
Baylis, S. A. ;
Chieppe, A. O. ;
Aguiar, S. F. ;
Fernandes, C. A. ;
Lemos, P. S. ;
Nascimento, B. L. S. ;
Monteiro, H. A. O. ;
Siqueira, I. C. ;
de Queiroz, M. G. ;
de Souza, T. R. ;
Bezerra, J. F. ;
Lemos, M. R. ;
Pereira, G. F. ;
Loudal, D. ;
Moura, L. C. ;
Dhalia, R. ;
Franca, R. F. .
NATURE, 2017, 546 (7658) :406-+
[5]   Zika virus in the Americas: Early epidemiological and genetic findings [J].
Faria, Nuno Rodrigues ;
da Silva Azevedo, Raimunda do Socorro ;
Kraemer, Moritz U. G. ;
Souza, Renato ;
Cunha, Mariana Sequetin ;
Hill, Sarah C. ;
Theze, Julien ;
Bonsall, Michael B. ;
Bowden, Thomas A. ;
Rissanen, Ilona ;
Rocco, Iray Maria ;
Nogueira, Juliana Silva ;
Maeda, Adriana Yurika ;
da Silva Vasami, Fernanda Giseli ;
de Lima Macedo, Fernando Luiz ;
Suzuki, Akemi ;
Rodrigues, Sueli Guerreiro ;
Ribeiro Cruz, Ana Cecilia ;
Nunes, Bruno Tardeli ;
de Almeida Medeiros, Daniele Barbosa ;
Guerreiro Rodrigues, Daniela Sueli ;
Nunes Queiroz, Alice Louize ;
Pinto da Silva, Eliana Vieira ;
Henriques, Daniele Freitas ;
Travassos da Rosa, Elisabeth Salbe ;
de Oliveira, Consuelo Silva ;
Martins, Livia Caricio ;
Vasconcelos, Helena Baldez ;
Neves Casseb, Livia Medeiros ;
Simith, Darlene de Brito ;
Messina, Jane P. ;
Abade, Leandro ;
Loureno, Jose ;
Junior Alcantara, Luiz Carlos ;
de Lima, Maricelia Maia ;
Giovanetti, Marta ;
Hay, Simon I. ;
de Oliveira, Rodrigo Santos ;
Lemos, Poliana da Silva ;
de Oliveira, Layanna Freitas ;
Silva de Lima, Clayton Pereira ;
da Silva, Sandro Patroca ;
de Vasconcelos, Janaina Mota ;
Franco, Luciano ;
Cardoso, Jedson Ferreira ;
da Silva Gonalves Vianez-Junior, Joao Lidio ;
Mir, Daiana ;
Bello, Gonzalo ;
Delatorre, Edson ;
Khan, Kamran .
SCIENCE, 2016, 352 (6283) :345-349
[6]   Genomic epidemiology reveals multiple introductions of Zika virus into the United States [J].
Grubaugh, Nathan D. ;
Ladner, Jason T. ;
Kraemer, Moritz U. G. ;
Dudas, Gytis ;
Tan, Amanda L. ;
Gangavarapu, Karthik ;
Wiley, Michael R. ;
White, Stephen ;
Theze, Julien ;
Magnani, Diogo M. ;
Prieto, Karla ;
Reyes, Daniel ;
Bingham, Andrea M. ;
Paul, Lauren M. ;
Robles-Sikisaka, Refugio ;
Oliveira, Glenn ;
Pronty, Darryl ;
Barcellona, Carolyn M. ;
Metsky, Hayden C. ;
Baniecki, Mary Lynn ;
Barnes, Kayla G. ;
Chak, Bridget ;
Freije, Catherine A. ;
Gladden-Young, Adrianne ;
Gnirke, Andreas ;
Luo, Cynthia ;
MacInnis, Bronwyn ;
Matranga, Christian B. ;
Park, Daniel J. ;
Qu, James ;
Schaffner, Stephen F. ;
Tomkins-Tinch, Christopher ;
West, Kendra L. ;
Winnicki, Sarah M. ;
Wohl, Shirlee ;
Yozwiak, Nathan L. ;
Quick, Joshua ;
Fauver, Joseph R. ;
Khan, Kamran ;
Brent, Shannon E. ;
Reiner, Robert C., Jr. ;
Lichtenberger, Paola N. ;
Ricciardi, Michael J. ;
Bailey, Varian K. ;
Watkins, David I. ;
Cone, Marshall R. ;
Kopp, Edgar W. ;
Hogan, Kelly N. ;
Cannons, Andrew C. ;
Jean, Reynald .
NATURE, 2017, 546 (7658) :401-+
[7]   Zika: the origin and spread of a mosquito-borne virus [J].
Kindhauser, Mary Kay ;
Allen, Tomas ;
Frank, Veronika ;
Santhana, Ravi Shankar ;
Dye, Christopher .
BULLETIN OF THE WORLD HEALTH ORGANIZATION, 2016, 94 (09) :675-686
[8]   Assessing the global threat from Zika virus [J].
Lessler, Justin ;
Chaisson, Lelia H. ;
Kucirka, Lauren M. ;
Bi, Qifang ;
Grantz, Kyra ;
Salje, Henrik ;
Carcelen, Andrea C. ;
Ott, Cassandra T. ;
Sheffield, Jeanne S. ;
Ferguson, Neil M. ;
Cummings, Derek A. T. ;
Metcalf, C. Jessica E. ;
Rodriguez-Barraquer, Isabel .
SCIENCE, 2016, 353 (6300)
[9]   Evolutionary enhancement of Zika virus infectivity in Aedes aegypti mosquitoes [J].
Liu, Yang ;
Liu, Jianying ;
Du, Senyan ;
Shan, Chao ;
Nie, Kaixiao ;
Zhang, Rudian ;
Li, Xiao-Feng ;
Zhang, Renli ;
Wang, Tao ;
Qin, Cheng-Feng ;
Wang, Penghua ;
Shi, Pei-Yong ;
Cheng, Gong .
NATURE, 2017, 545 (7655) :482-+
[10]   Zika virus evolution and spread in the Americas [J].
Metsky, Hayden C. ;
Matranga, Christian B. ;
Wohl, Shirlee ;
Schaffner, Stephen F. ;
Freije, Catherine A. ;
Winnicki, Sarah M. ;
West, Kendra ;
Qu, James ;
Baniecki, Mary Lynn ;
Gladden-Young, Adrianne ;
Lin, Aaron E. ;
Tomkins-Tinch, Christopher H. ;
Ye, Simon H. ;
Park, Daniel J. ;
Luo, Cynthia Y. ;
Barnes, Kayla G. ;
Shah, Rickey R. ;
Chak, Bridget ;
Barbosa-Lima, Giselle ;
Delatorre, Edson ;
Vieira, Yasmine R. ;
Paul, Lauren M. ;
Tan, Amanda L. ;
Barcellona, Carolyn M. ;
Porcelli, Mario C. ;
Vasquez, Chalmers ;
Cannons, Andrew C. ;
Cone, Marshall R. ;
Hogan, Kelly N. ;
Kopp, Edgar W. ;
Anzinger, Joshua J. ;
Garcia, Kimberly F. ;
Parham, Leda A. ;
Gelvez Ramirez, Rosa M. ;
Miranda Montoya, Maria C. ;
Rojas, Diana P. ;
Brown, Catherine M. ;
Hennigan, Scott ;
Sabina, Brandon ;
Scotland, Sarah ;
Gangavarapu, Karthik ;
Grubaugh, Nathan D. ;
Oliveira, Glenn ;
Robles-Sikisaka, Refugio ;
Rambaut, Andrew ;
Gehrke, Lee ;
Smole, Sandra ;
Halloran, M. Elizabeth ;
Villar, Luis ;
Mattar, Salim .
NATURE, 2017, 546 (7658) :411-+