抗生素的滥用导致耐药性细菌的出现并泛滥，细菌的耐药性及其耐药基因可通过食物链从动物传播给人类，这对人类的健康造成直接威胁。本研究从广州市六家超市及三家农贸市场中采集110份生猪肉样品，根据国标GB4789.10—2010对样品进行金黄色葡萄球的分离及鉴定，采用纸片扩散法（K-B）进行抗生素敏感实验，用多位点序列分型（MLST）进行分子分型，采用PCR法验证MRSA并筛选检测第一类整合子及相关耐药基因盒，并探讨第一类整合子整合酶（IntI1）介导的耐药基因盒在不同菌种间的水平转移的研究。具体内容如下：
首先按照随机采样法采集生猪肉样品110份，其中生鲜瘦肉50份，排骨29份，内脏类31份，按照国标法分离鉴定金黄色葡萄球菌，共有34份样品检出被金黄色葡萄球菌，每份阳性样品保存一株菌株，共得到34株金黄色葡萄球菌。其中50份生鲜瘦肉中检出16份，检出率为32%，29份排骨样品检出率最高为34.5%，内脏类样品检出率为25.8%，各类样品间检出率没有显著性差异。35份采自农贸市场的生猪肉样品检出10株金黄色葡萄球菌，检出率为28.6%，75份采自超市的猪肉样品中金黄色葡萄球菌的检出率为32.0%(n=24)。
对分离得到的34株菌株进行采用CLSI2012推荐的纸片扩散法抗生素敏感实验，耐药率由高到低依次为：青霉素100%、四环素88.2%、甲氧苄胺嘧啶76.5%、红霉素64.7%、克林霉素61.8%、利福平44.1%、头孢西丁38.3%、米诺环素35.3%、氯霉素17.6%、庆大霉素17.6%、诺氟沙星14.7%、呋喃妥因8.8%。MRSA检出率为38.3%（13/34），PCR验证mecA基因，对比药敏实验结果，符合率为76.9%（10/13）。本次实验共获得26种耐药表型谱，其中34株金黄色葡萄球菌对2种抗生素耐药的为5.9%(2/34)，对3种抗生素耐药的为5.9%(2/34)，对4种抗生素耐药的为11.8%(4/34)，对5种抗生素耐药的为23.5%(8/34)，多重耐药率高达52.9%(18/34)，多重耐药菌株以对β-内酰胺类、大环内酯类和四环素类均耐药为主，占66.7%。
为了解不同菌株间是否同源，确定其相关性，对所有34株金黄色葡萄球菌进行多位点序列分型，所有34株菌共分成7个序列分型，分别为ST6（1/34）、ST7（16/34）、ST9（9/34）、ST59（1/34）、ST239（4/34）、ST2259（2/34），并获得一株等位基因谱为5-4-1-4-4-6-53的新型ST。本实验发现广州市售猪肉序列型以ST7为主，占47.1%，ST9次之，占26.5%，MRSA序列型发现有两种分别为ST9（6/10）和ST239（4/10）。
对第一类整合子整合酶基因PCR结果显示，34株菌中有5株菌PCR阳性，即第一类整合酶阳性率为14.7%。对整合酶阳性的菌株进行第一类整合子可变区扩增，结果显示有2株菌含携带大小不一的可变区序列，分别为frA17-aadA5，EstX基因盒。对含frA17-aadA5的菌株提取质粒，研究第一类整合酶介导的耐药基因盒在不同菌种间的水平转移：转化及自然转移，均取的了成功，提示第一整合子可以在不同菌间传播。
综上所述，实验显示生猪肉中金黄色葡萄球菌污染比较严重，且具有严重的抗生素耐药现象，ST7为主要的序列型号，第一类整合子存在于食源性金黄色葡萄球菌中，相关基因盒对菌株耐药发挥作用，且I类整合子可以在不同菌间传播。
