溃疡性结肠炎和其它肠道疾病肠道菌丛结构的ERIC-PCR指纹图谱分析

背景及目的:溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)是一种慢性非特异性肠道炎症性疾病,是炎症性肠病(Inflammatory Bowel Disease,IBD)的一种,近年来在我国的发病率有逐渐上升的趋势。UC的发病机制至今仍不清楚,目前遗传易感性、黏膜免疫和肠道微生态环境三者的相互作用被认为可能参予UC的发病。现在流行的学说解释UC的发生机制是由于基因易感宿主对肠道共栖菌的免疫反应增强引起的。近年来随着微生态学的发展,肠道菌群与UC发病的关系日益受到关注。但至今尚未找到某一特异病原微生物与UC有恒定关系。由于目前能够分离培养的肠道细菌种类只占肠道细菌总数的少数,而以ERIC-PCR技术为基础的DNA指纹图谱可以用来分析肠道菌群的组成。ERIC序列(Enterobacterial Repetitive hatergenic Consensus,肠杆菌基因间的重复共有序列)是主要存在于肠道细菌中的一段长为126 bp的反向重复序列,位于基因组内可转录的非编码区域或者与转录有关的区域。该序列高度保守,而且染色体定位具有种特异性。ERIC-PCR技术是利用ERIC核心的高度保守序列设计引物进行PCR,ERIC-PCR扩增的产物大小在50-3000bp之间,每种菌株均存在数目不等的各自独特的电泳带型,各特异性扩增的主带型能重复稳定出现,可以区别不同种类的细菌和同一种类细菌中不同的菌株。因此本研究应用ERIC-PCR技术建立UC患者、急性胃肠炎患者、IBS患者及正常对照者的肠道细菌DNA指纹图谱,分析UC患者、急性胃肠炎患者、IBS患者及正常对照者的肠道菌丛的整体差异。 方法:采集19例UC、11例急性胃肠炎、6例IBS患者及11例正常对照者的粪便标本,提取肠道细菌总DNA;应用ERIC-PCR技术建立各组肠道细菌DNA指纹图谱,分析UC、急性胃肠炎、IBS患者及正常对照者的肠道菌丛的整体差异。 结果:经分析发现四组研究对象的肠道菌丛存在整体差异:UC组ERIC-PCR指纹图谱电泳DNA条带较少,IBS组、急性胃肠炎组和正常对照组ERIC-PCR指纹图谱电泳DNA条带多;UC组中有18个样本主带分布非常一致,均出现在约0.7 kb处,急性胃肠炎组主带分布也非常一致,均出现在约1.1kb和0.8kb处;正常对照组和IBS组主带位置无统一趋势。 结论:与IBS、急性胃肠炎组和正常对照组相较,US组肠道优势菌群种类少;UC组和急性胃肠炎组各有分布较一致的主带;UC可能存在较单一的肠道优势细菌,推测其发病机制可能与特定的肠道优势细菌感染有关。