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亚麻SRAP-PCR反应体系的优化建立及多态性标记筛选
被引:6
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张建平
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党占海
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赵利
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李闻娟
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甘肃省农科院作物研究所 甘肃农业大学农学院
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[1] 甘肃农业大学农学院
[2] 甘肃省农科院作物研究所
来源:
关键词:
亚麻;
SRAP标记;
正交试验;
体系优化;
引物筛选;
D O I:
10.13432/j.cnki.jgsau.2013.05.008
中图分类号:
S563.2 [亚麻];
学科分类号:
摘要:
以亚麻叶片DNA为模板,以Mg2+浓度、dNTPs浓度、引物和Taq DNA聚合酶进行4因素3水平正交试验设计,对亚麻SRAP反应体系进行优化,并比较了不同浓度模板DNA对扩增效果的影响,建立了亚麻的SRAP最佳反应体系.结果表明:亚麻SRAP-PCR最佳反应体系为2.5μL 10×Loading buffer、Mg2+浓度3.0mmol/L、dNTPs浓度0.25mmol/L、引物浓度0.2μmol/L、Taq DNA聚合酶1.0U、模板DNA 75ng,总体积为25μL.各因素对扩增反应结果均有不同影响,其中以Mg2+浓度影响最大,Taq DNA聚合酶的影响最小.运用该体系对15份不同来源亚麻品种进行验证,证明该体系稳定可靠,并从169个SRAP引物组合中筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的引物组合21个.
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党占海
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甘肃省农业科学院作物研究所 甘肃农业大学农学院

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李猛
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上海市农业生物基因中心
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刘灶长
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上海市农业生物基因中心 上海市农业生物基因中心

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张喜娟
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郭志富
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刘赢男
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机构: 东北林业大学

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机构: 东北林业大学