基于生物信息学探讨骨质疏松症与肌少症的关系

被引:13
作者
商海滨 [1 ]
廉由之 [1 ]
郭海玲 [2 ,3 ]
杨光月 [2 ,3 ]
邓真 [1 ]
艾有利 [1 ]
陈蓓 [1 ]
李国中 [1 ]
赵咏芳 [2 ,3 ]
机构
[1] 上海市宝山区中西医结合医院上海中医药大学附属曙光医院宝山分院
[2] 上海中医药大学附属曙光医院石氏伤科医学中心
[3] 上海市中医药研究院骨伤科研究所
关键词
生物信息学; 骨质疏松症; 肌少症; 分子机制;
D O I
暂无
中图分类号
R580 []; R685 [肌肉疾病及损伤];
学科分类号
100220 [骨科学];
摘要
目的基于生物信息学探讨骨质疏松症与肌少症的关系。方法通过7个大型疾病数据库(CTD、Disgenet、TTD、OMIM、GeneC ards、Drugbank、KEGG数据库)对骨质疏松症和肌少症的相关基因进行分析筛选,并对筛选结果进行基因GO富集分析以及KEGG通路分析,利用STRING网站对骨质疏松症与肌少症共同靶点基因进行蛋白互作网络分析,并进行基因富集分析和KEGG通路分析。结果通过疾病数据库筛选分别选出与骨质疏松症和肌少症相关基因1 782个、429个。通过基因富集分析和KEGG通路分析,骨质疏松症与肌少症相关通路集中在PI3K-Akt、Longevity调控、FoxO、AGE-RAGE、HIF-1、AMPK、JAK-STAT、MAPK、Insulin、TNF以及Apoptosis过程。结论骨质疏松症与肌少症均为复杂代谢性疾病,涵盖众多差异表达基因,但两种疾病发病过程中依然存在一些高度重合的差异基因表达,其可同时对两种疾病进行调控作用。这提示骨质疏松症与肌少症之间发病机制存在密切关联,共同靶点基因可作为同时干预两种疾病的治疗目标。
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页码:1458 / 1463
页数:6
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