DNA条形码技术在田间常见蓟马种类识别中的应用

被引：31

作者：

乔玮娜 ^{[1
]}

万方浩 ^{[1
,2
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张爱兵 ^{[3
]}

闵亮 ^{[1
]}

张桂芬 ^{[1
,2
]}

机构：

[1] 中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室

[2] 农业部外来入侵生物预防与控制研究中心

[3] 首都师范大学生命科学学院

来源：

昆虫学报 | 2012年 / 55卷 / 03期

关键词：

缨翅目; 蓟马; COⅠ基因; DNA条形码; 分子鉴定; 遗传距离; 系统发育树;

D O I：

10.16380/j.kcxb.2012.03.007

中图分类号：

S433 [植物虫害及其防治];

学科分类号：

090402 ;

摘要：

蓟马类害虫种类多、体型小,传统的形态学鉴定方法难以快速准确识别。本研究利用DNA条形码通用型引物,以我国田间常见的25种蓟马为靶标扩增其线粒体DNA细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(mitochondrial cytochrome coxidase subunit Ⅰ gene,mtDNA COⅠ)基因(约650bp),通过对靶标片段碱基序列的测序及比对分析,以邻接法(NJ法)构建系统发育树,并以Kimura双参数模型计算种内、种间遗传距离。结果表明:聚类分析与形态学鉴定结果一致,表现为较长的种间分支和较短的种内分支,每个单系分支对应一个物种,同一物种不同单倍型的最初分支自展值均为100%。25种蓟马的种内平均遗传距离为0.0027,种间平均遗传距离为0.2757,种间遗传距离为种内遗传距离的102.1倍;而且种内、种间遗传距离没有重叠区域。结果说明基于COⅠ基因的DNA条形码技术可以用于不同种类蓟马的快速准确鉴别。

引用

页码：344 / 356

页数：13

共 21 条

[1] 基于DNA条形码技术的泰国番石榴中实蝇幼虫分子鉴定研究附视频 [J].

Buahom Nopparat ;

李志红 ;

吴佳教 ;

刘佳琪 .

植物检疫, 2011, (01) :49-52

[2] 我国新入侵外来害虫美洲棘蓟马的外部形态和分子鉴定 [J].

魏书军 ;

马吉德 ;

石宝才 ;

宫亚军 ;

刘静 ;

康总江 ;

陈学新 ;

路虹 .

昆虫学报, 2010, 53 (06) :715-720

[3] 西花蓟马的SCAR分子检测技术 [J].

孟祥钦 ;

闵亮 ;

万方浩 ;

周忠实 ;

王文凯 ;

张桂芬 .

昆虫学报, 2010, 53 (03) :323-330

[4] 利用CoI基因序列对雀科鸟类的分子系统发育关系初探 [J].

梁刚 ;

李涛 ;

尹祚华 ;

雷富民 .

动物学研究, 2008, (05) :465-475

[5] 西花蓟马在黄瓜和架豆上的空间分布型及理论抽样数 [J].

路虹 ;

宫亚军 ;

石宝才 ;

宋婧祎 .

昆虫学报, 2007, (11) :1187-1193

[6] 入侵害虫西花蓟马及其他8种常见蓟马的分子鉴定 [J].

游中华 ;

路虹 ;

张宪省 ;

冯纪年 ;

石宝才 ;

宫亚军 ;

黄大卫 .

昆虫学报, 2007, (07) :720-726

[7] DNA条形编码在蚜虫类昆虫中的应用 [J].

王剑峰 ;

乔格侠 .

动物分类学报, 2007, (01) :153-159

[8] Taqman real-time quantitative PCR for identification of western flower thrip (Frankliniella occidentalis) for plant quarantine [J].

Huang, K. S. ;

Lee, S. E. ;

Yeh, Y. ;

Shen, G. S. ;

Mei, E. ;

Chang, C. M. .

BIOLOGY LETTERS, 2010, 6 (04) :555-557

[9]

Barcoding Tetrahymena : Discriminating Species and Identifying Unknowns Using the Cytochrome c Oxidase Subunit I （cox-1） Barcode[J] . Chandni P. Kher,F. Paul Doerder,Jason Cooper,Pranvera Ikonomi,Undine Achilles-Day,Frithjof C. Küpper,Denis H. Lynn.Protist . 2010 (1)

[10] Application of barcoding to Amazonian commercial fish labelling [J].

Ardura, Alba ;

Pole, Ivan G. ;

Ginuino, Ione ;

Gomes, Vanessa ;

Garcia-Vazquez, Eva .

FOOD RESEARCH INTERNATIONAL, 2010, 43 (05) :1549-1552

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