绰墩山遗址古水稻土细菌与古菌群落的PCR-DGGE分析

在江苏苏州绰墩山遗址考古发掘中,发现了在剖面不同深度埋藏的距今约6280a的新石器时期灌溉古水稻田土层和距今约3320a的商周时期的古水稻田土层。为了解古代水稻种植活动对土壤中细菌、古菌及产甲烷古菌群落多样性的影响,以土壤剖面P-01(包含100～116cm新石器时期水稻土,42～57cm商周时期水稻土,0～15cm现代水稻土和174～200cm土壤母质)为对象,利用细菌、古菌及产甲烷古菌群落16SrDNA的高可变区V3区的PCR-DGGE分析技术,研究了不同土层细菌、古菌及产甲烷古菌群落多样性。结果表明:利用PCR-DGGE技术成功获得了古水稻土细菌、古菌及产甲烷古菌群落的分子指纹图谱。现代水稻土、商周时期古水稻土和新石器时期古水稻土中细菌、古菌及产甲烷古菌群落的DGGE条带类型各不相同,并且DGGE条带类型都较母质层丰富多样。UPGAMA聚类分析可以将不同时期水稻土及母质层的细菌、古菌及产甲烷古菌群落区分开来。埋藏古水稻土中仍有较多的细菌、古菌与产甲烷古菌存活。与母质层相比,不同时期水稻种植活动均增加了细菌、古菌与产甲烷古菌群落多样性。不同时期水稻种植活动可以引起特异性的细菌、古菌与产甲烷古菌群落发育,而且不同的栽培措施可能导致不同的优势种群。