【目的】本文提出隐含在科技评价指标中的数据自然权重问题,并提出了修正方法。【方法】以JCR2016数学期刊和TOPSIS评价方法为例,分析自然权重对非线性评价方法的影响,提出动态最大均值逼近标准化方法,以消除自然权重的影响。【结果】自然权重对非线性评价方法影响较大,对于加权类非线性评价方法,设计权重、自然权重和评价方法共同影响实际权重,对于非加权类线性评价方法,自然权重和评价方法影响实际权重;自然权重消除后可以有效降低评价方法对实际权重的影响,从而充分发挥设计权重的作用,这符合评价公理;指标数据分布特点也会影响实际权重。【局限】用来消除自然权重的动态最大均值逼近标准化方法是一种逼近算法,均值标准化结果难以完全相等。【结论】在科技评价中必须重视自然权重问题,这是一种系统误差,消除后才能保证评价公平。