云南糯稻遗传多样性的SSR分析

被引:16
作者
杨慧
陆春明
贾亦飞
韩光煜
李利国
段琳
王云月
机构
[1] 云南农业大学植物保护学院,农业生物多样性应用技术国家工程研究中心
关键词
糯稻; 遗传多样性; SSR标记;
D O I
暂无
中图分类号
S511.23 [];
学科分类号
0901 ;
摘要
用24对单序列重复(simple sequence repeat,SSR)引物分析云南省63个糯稻品种的遗传多样性,结果显示云南糯稻总体遗传多样性水平较高。24个SSR位点共检测到153个等位基因,均为中度或高度多态位点。总群体平均香农指数为1.4493,平均Nei's基因多样性指数为0.7187。滇西南、滇南和滇东南是目前云南省糯稻遗传多样性中心,是保护糯稻资源时应重点关注的区域。AMOVA分析表明糯稻的遗传变异主要存在于地区内品种间(79%),只有5%遗传变异存在于地区间,品种内的遗传变异占16%,保护糯稻遗传多样性需要保护较多的品种。聚类分析显示Nei's遗传相似系数为0.22时云南糯稻品种分为籼糯和粳糯2个类群,但是不能区分地理组。
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