鲫鱼生长激素Ⅰ基因内含子2的多态性分析

利用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳 (Denaturing PolyacrylamidGelElectrophoresis,DPAGE)和单链构象多态性(Single StrandConformationPolymorphism ,SSCP)分析技术 ,在普通鲫鱼种群 (7个野生鲫鱼群体和 2个金鱼群体 )和银鲫种群 (1个方正银鲫群体 )共 16 2个个体生长激素Ⅰ (GrowthHormoneⅠ ,GHⅠ )基因的内含子 2中检测到丰富的长度和序列多态性。在所有群体中 ,GHⅠ基因内含子 2的长度存在 7种类型 ,分别为A、B、C、D、E、F和G型 ,变异频率为 4 32 % ;其序列存在 15种单倍型 ,分别为A1、A2、A3、B、C1、C2、D1、D2、D3、D4、D5、E1、E2、F和G型 ,变异频率为 9 2 6 %。对这 15种单倍型的DNA序列进行分析 ,结果表明 :1)鲫鱼GHⅠ基因内含子 2的扩增DNA片段长为 2 4 3～ 2 6 3bp ,其中包括部分外显子 2 (3′端 ,33bp)、内含子 2和部分外显子 3(5′端 ,2 1bp)。 15种单倍型A、T、G、C碱基平均百分比组成分别为 34 13%、37 36 %、15 13%、13 38% ,其中G +C(2 8 5 1% )含量明显小于A +T(71 4 9% )含量。内含子 2与外显子 2、3的接头区存在GT—AG保守序列 ,此为真核基因中mRNA剪接的识别信号。内含子 2的 5′端存在有一序列为GTAAGAT的保守区域 ,在其近 3′端分布有一高丰度嘧啶区 ;2 )内含子 2的 7种长度类型A