茶树多酚氧化酶基因的SNP分析

被引:20
作者
黄建安 [1 ]
黄意欢 [1 ]
罗军武 [1 ]
李家贤 [2 ]
龚志华 [1 ]
刘仲华 [1 ]
机构
[1] 湖南农业大学茶学教育部重点实验室
[2] 广东省农业科学院茶叶研究所
关键词
茶树; 多酚氧化酶基因; 单核苷酸多态性;
D O I
10.13331/j.cnki.jhau.2007.04.021
中图分类号
S571.1 [茶];
学科分类号
0902 ; 090203 ;
摘要
选取有代表性的40个茶树品种(系)为材料,先采用PCR-SSCP-银染检测技术,对供试材料的多酚氧化酶(PPO)基因进行SSCP分析,对PPO基因作初步基因分型;根据分型分析结果,对每一类型选择典型品种的PPO基因作进一步的DNA序列分析,用DNASTAR Program进行单核苷酸多态性(SNP)搜寻.结果表明,茶树PPO基因存在丰富的SNP,其类型包括:转换(AG,CT)、颠换(AT,GC,G→T,A→C)与杂合子(C/T,A/G,G/T,A/T,A/C,G/C).在发现的37个SNPs中,有13个SNPs发生在核酸内切酶酶切位点,有10个错义SNPs位点导致氨基酸的改变.在PPO基因的保守序列区,出现SNP的频率较低.
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页码:454 / 458+485 +485
页数:6
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