基于16S rRNA高通量测序的西藏农、牧区牦牛酸奶菌群多样性分析

被引:18
作者
刘怡萱 [1 ,2 ]
许国琪 [1 ,2 ]
曹鹏熙 [1 ,2 ]
金彦龙 [1 ]
李小燕 [3 ]
刘星 [1 ,2 ,3 ]
机构
[1] 西藏大学理学院
[2] 西藏大学生态学研究中心极端环境生物资源与适应性进化实验室
[3] 武汉大学生命科学学院武汉大学-西藏大学生态与保护联合研究中心
关键词
青藏高原; 牦牛酸奶; 微生物多样性; 高通量测序技术; 16S rRNA;
D O I
暂无
中图分类号
TS252.54 [发酵乳制品];
学科分类号
082203 ;
摘要
运用高通量测序技术,对西藏农、牧区牦牛酸奶中细菌多样性及其差异进行分析,并探究环境因素对其差异形成的影响。样本层级聚类及主坐标分析结果显示农、牧区的样本菌群结构具有明显差异;多级物种差异判别分析及组间差异分析表明,农、牧区牦牛酸奶菌群的优势属均为厚壁菌门(Firmicutes)下的乳杆菌属(Lactobacillus)、乳球菌属(Lactococcus)及链球菌属(Streptococcus),上述3个属及其余7个丰度相对较低的属在不同区域牦牛酸奶中具有显著差异(P<0.05);对环境因子的回归分析和基于距离的冗余分析显示海拔高度对样本间差异的解释度大于年平均气温。本研究为进一步揭示自然环境与青藏高原发酵食品中微生物多样性之间的关系、筛选优良菌种提供参考。
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