微滴数字PCR(ddPCR)检测马铃薯S病毒(PVS)

被引：9

作者：

张永江 ^{[1
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黄洁芳 ^{[2
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王溪桥 ^{[3
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周慧 ^{[4
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李晓宇 ^{[3
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付伟 ^{[1
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朱鹏宇 ^{[1
]}

王晨光 ^{[1
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机构：

[1] 中国检验检疫科学研究院

[2] 吴江出入境检验检疫局

[3] 甘肃出入境检验检疫局综合技术中心

[4] 海南出入境检验检疫局热带植物隔离中心

来源：

农业生物技术学报 | 2017年 / 25卷 / 10期

基金：

国家重点研发计划;

关键词：

马铃薯S病毒(PVS); 微滴数字PCR(ddPCR); 检测鉴定; 特异性; 灵敏度;

D O I：

暂无

中图分类号：

S435.32 [马铃薯（土豆）病虫害];

学科分类号：

摘要：

马铃薯(Solanum tuberosum)为世界重要农作物之一,受马铃薯S病毒(Potato virus S,PVS)侵染会导致其品质下降,产量降低;灵敏准确的检测技术将有助于提高PVS的检出率,进而防止其传播扩散危害马铃薯生产,保护马铃薯产业发展。为了建立PVS灵敏准确的检测技术,本研究根据其外壳蛋白(coat protein,CP)基因保守序列设计了微滴数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)的引物探针,并进行了特异性、灵敏度及重复性验证。结果表明,所建立的方法对PVS具有良好的特异性,能够有效区分对照病毒马铃薯X病毒(Potato virus X,PVX)、马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)、黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)和烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV),与传统qRT-PCR结果一致;检测灵敏度可达20拷贝/μL的RNA,比qRT-PCR灵敏度高10倍;3次重复实验微滴数的标准误差小于总微滴数的1.5%,表明所建立的ddPCR方法具有良好的重复性。本研究建立的ddPCR方法可用于PVS的准确检测,也为其他植物病毒的准确检测提供了借鉴。

引用

页码：1721 / 1728

页数：8

共 15 条

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