香蕉EST-SSRs标记的开发与应用

被引：37

作者：

王静毅 ^{[1
]}

陈业渊 ^{[2
]}

刘伟良 ^{[1
]}

武耀廷 ^{[3
]}

机构：

[1] 中国热带农业科学院热带作物生物技术研究所

[2] 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所

[3] 海南大学农学院,热带园艺植物资源与遗传改良教育部重点实验室

来源：

遗传 | 2008年 / 07期

基金：

海南省自然科学基金;

关键词：

香蕉; EST; EST-SSR; 遗传多样性; 聚类分析;

D O I：

暂无

中图分类号：

S668.1 [香蕉];

学科分类号：

摘要：

从NCBI搜索的2282条香蕉EST中,发掘出含有SSR的EST序列110条,共有122个SSR位点,检出率为5.3%。SSR位点可分为37种重复单元,平均长度为20bp,其中二、三核苷酸重复单元的SSR占主导地位,分别占总SSR的33.1%和47.6%。GA和GAA是二、三核苷酸中的优势重复类型,分别占二、三核苷酸重复类型的75.7%和36.0%;其他重复类型所占比例均不足10%,而四核苷酸重复类型最少,为4.0%。设计的63对EST-SSRs引物中,有41对EST-SSRs引物对巴西蕉基因组DNA能扩增出产物,占总引物数的65.1%。应用进一步筛选出的重复性好、多态性高的19对引物对49个香蕉品种(系)进行PCR扩增。每对引物扩增的多态性带数目为4～12个,平均7.58个;引物多态信息量变化范围为0.3572～0.8744,平均0.7324。在相似系数为0.63的水平可将49个品种聚为2个类群:一类为含B基因组香蕉品种;另一类为不含B基因组的香蕉品种,表明EST-SSR引物可以应用于香蕉品种资源分类的研究。

引用

页码：933 / 940

页数：8

共 19 条

[1] 中国主栽香蕉品种和INIBAP引进品种的SSR分析研究 [J].