石蒜属植物实时荧光定量PCR内参基因的选择

被引:48
作者
蒋婷婷
高燕会
童再康
机构
[1] 浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地
关键词
石蒜属; 实时荧光定量PCR; 内参基因;
D O I
10.16420/j.issn.0513-353x.2014-0999
中图分类号
S682.29 [];
学科分类号
摘要
以石蒜属植物换锦花(Lycoris sprengeri)、石蒜(Lycoris radiata)和中国石蒜(Lycoris chinensis Traub)不同组织器官、不同花发育时期以及不同杂交种的幼小鳞茎为研究材料,利用q RT-PCR技术检测Actin、EF-1α、GAPDH、5S r RNA、Ubiquitin和β-Tubulin等6个内参基因的m RNA表达情况,利用ge Norm、Norm Finder、Best Keeper和Reffinder软件综合评价6个内参基因的表达稳定性。结果表明,石蒜属植物种间和种内内参基因表达差异明显,在分析换锦花不同组织基因表达时可选用β-Tubulin、Actin和GAPDH作为内参基因,分析不同花期的基因表达时宜选用5S r RNA、EF-1α、Actin和β-Tubulin作内参基因。中国石蒜不同组织最合适的内参基因是5S r RNA、Ubiquitin、EF-1α和β-Tubulin,而不同花期最合适的内参基因则是Ubiquitin、β-Tubulin。分析石蒜不同组织间基因表达的适宜内参基因是β-Tubulin和5S r RNA,不同花期为Ubiquitin、β-Tubulin以及5S r RNA。不同杂交种鳞茎适宜内参基因为β-Tubulin和Actin。
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