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牙鲆微卫星标记的筛选及群体遗传结构分析
被引:18
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孙效文
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中国水产科学研究院黑龙江水产研究所
中国水产科学研究院水产生物应用基因组研究中心 大连海洋大学生命科学与技术学院
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[1] 大连海洋大学生命科学与技术学院
[2] 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所
[3] 中国水产科学研究院水产生物应用基因组研究中心
来源:
关键词:
牙鲆;
微卫星;
遗传结构;
D O I:
暂无
中图分类号:
S917.4 [水产动物学];
学科分类号:
0908 ;
摘要:
采用生物素-磁珠吸附微卫星与质粒二次检测相结合的方法克隆牙鲆微卫星,并利用所得到的引物分析野生群体遗传结构。共获得2805个阳性克隆,测序得到3120个含微卫星的序列。其中完美型、非完美型和混合型分别占57.97%、7.25%和34.78%。用Primer3.0软件设计牙鲆微卫星引物,从中筛选出具稳定多态性的30对,分析中国黄海、渤海海域4个不同海区牙鲆野生群体(大连、北戴河、丹东、青岛)遗传结构。结果显示:有效等位基因数为3.93~9.94,平均为6.95;观测杂合度为0.532~0.895,平均为0.753;期望杂合度为0.635~0.902,平均为0.820;Hardy-Weinberg平衡指数(d)的变化范围为-0.247~0.512,其中7个位点表现为杂合子过剩(d>0),其余位点表现为杂合子缺失(d<0)。聚类分析显示:4个群体聚为两类,大连与丹东聚为一类,北戴河与青岛聚为一类。
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梁利群
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2006, (01)
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:772-776

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2005, (05)
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;
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;
梁利群
.
水产学报,
2005, (04)
:482-486

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王伟
;
尤锋
;
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;
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海洋与湖沼,
2004, (06)
:530-537

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李霞
;
白俊杰
;
吴淑勤
;
叶星
;
劳海华
;
简清
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2004, (03)
:196-201

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;
胡骏
;
李晓方
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遗传,
2003, (05)
:615-619

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